Homotherium era um género de gatos com dentes de cimitarra de corpo grande, morfologicamente distintos de qualquer espécie de felídeo existente, que se extinguiu no final do Pleistoceno . Possuíam dentes caninos grandes e serrilhados em forma de sabre, membros anteriores poderosos, um dorso inclinado e um bulbo óptico aumentado, características chave para a predação da megafauna do Pleistoceno. Filogenias anteriores de DNA mitocondrial sugeriam que era uma linhagem irmã altamente divergente para todas as espécies de gatos existentes. Contudo, as filogenias mitocondriais podem ser enganadas pela hibridização, pela classificação incompleta da linhagem (ILS), ou por padrões de dispersão preconceituosos de sexo, que podem ser especialmente relevantes para o Homotherium, uma vez que foram descobertas discrepâncias mito-nucleares generalizadas nos gatos modernos. Para examinar a história evolutiva do Homotério, nós geramos um ∼7x genoma nuclear e um ∼38x exome de H. latidens usando shotgun e abordagens de seqüenciamento de captura de alvo. As análises filogenéticas revelam o Homotério como altamente divergente (∼22.5 Ma) das espécies de gatos vivos, sem sinais detectáveis de fluxo gênico. Análises genômicas comparativas encontraram assinaturas de seleção positiva em vários genes, incluindo aqueles envolvidos na visão, função cognitiva e consumo de energia, putativamente consistente com a atividade diurna, comportamento social bem desenvolvido, e caça superficial. Finalmente, descobrimos níveis relativamente altos de diversidade genética, sugerindo que o Homotherium pode ter sido mais abundante do que o limitado registro fóssil sugere. Nossos achados complementam e ampliam as inferências anteriores, tanto do registro fóssil como dos estudos moleculares iniciais, melhorando nossa compreensão da evolução e ecologia desta notável linhagem.

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