Honda comenzó a patinar a los dos años tras seguir a su hermano mayor, Taichi, en el patinaje artístico.
A partir de la temporada 2011-12, Honda subió al podio en cuatro campeonatos japoneses de novatos consecutivos, con una medalla de oro en 2012-13. Fue invitada a patinar en la gala del Trofeo Mundial por Equipos en esa misma temporada. Fue 5ª en los Campeonatos Juveniles de Japón de 2013-14 y 4ª la temporada siguiente, entrenando en la pista de hielo de la Universidad de Kansai. Como medalla de plata de los nacionales novatos de 2014, fue invitada a patinar en la gala del Trofeo NHK 2014. Su Lutz y su flip se ven obstaculizados por el hallux valgus.
Temporada 2015-16: Campeón del Mundo JuniorEditar
Honda debutó en el circuito ISU Junior Grand Prix (JGP) en la temporada 2015-16. Clasificada en primer lugar en el programa corto y en cuarto lugar en el patinaje libre, se hizo con la medalla de plata en los JGP de Colorado Springs (Colorado), habiendo terminado por detrás de Yuna Shiraiwa por un margen de 8,06 puntos. Ganó la medalla de oro en su segundo JGP, en Zagreb (Croacia), tras quedar tercera en el corto y primera en el libre, superando a Wakaba Higuchi por 6,16 puntos. Estos resultados la clasificaron para la final de los JGP 2015-16 en Barcelona. En noviembre, Honda quedó sexta en los Campeonatos Juveniles de Japón 2015-16.
En la final de los JGP 2015-16 en Barcelona, Honda ganó la medalla de bronce por detrás de las rusas Polina Tsurskaya y Maria Sotskova.
En su debut en los Campeonatos de Japón a nivel senior, Honda terminó novena, y fue nombrada en el equipo de Japón para los Campeonatos Mundiales Juveniles 2016 en Debrecen. Clasificada segunda en el programa corto y primera en el patinaje libre, se hizo con el oro en Hungría, por delante de la rusa Maria Sotskova y de su compañera de equipo Wakaba Higuchi.
Temporada 2016-17Editar
Honda comenzó su temporada con una medalla de oro en el Trofeo de Asia 2016. Fue asignada a los eventos JGP de Japón y Eslovenia. En su primera prueba en los JGP de Yokohama, quedó quinta en el programa corto y ganó el patinaje libre con un récord mundial junior de 128,64 puntos para situarse segunda en la general. En su siguiente prueba, en los JGP de Liubliana, ganó otra medalla de plata, lo que la clasificó para su segunda final de los JGP. Sin embargo, se retiró de la final por enfermedad. En noviembre, ganó la medalla de bronce en los Campeonatos Nacionales Junior de Japón.
Se clasificó en cuarto lugar en su segundo Campeonato Nacional de Japón senior y fue asignada para competir en los Campeonatos Mundiales Junior de 2017 en Taipei. Se clasificó en segundo lugar en ambos segmentos, estableciendo nuevas marcas personales y recibió la medalla de plata por detrás de la medallista de oro Alina Zagitova y por delante de la medallista de bronce Kaori Sakamoto. Fue invitada a patinar en la gala del Trofeo Mundial por Equipos 2017.
Temporada 2017-18: Debut en categoría séniorEditar
Honda comenzó su debut en categoría sénior con una medalla de oro en el US Classic 2017 en Salt Lake City. Compitió en su primera prueba por equipos en el Open de Japón y ganó la medalla de plata con sus compañeras.
Honda debutó en el Grand Prix senior en el Skate Canada 2017. Quedó décima en el programa corto tras caerse en su combinación de triple Lutz-triple toe y convertir su planeado doble Axel en un simple, pero logró colocarse tercera en el patinaje libre para quedar quinta en la general. En su siguiente evento, en la Copa de China 2017, fue sexta en el programa corto y quinta en el patinaje libre para quedar quinta en la general. En los Nacionales de Japón 2017-18, fue sexta en el programa corto y novena en el patinaje libre, quedando séptima en la general. Posteriormente compitió en la Challenge Cup 2018, donde fue undécima tras el programa corto. Quedó segunda en el patinaje libre, ganando la medalla de bronce.
El 30 de marzo, anunció que cambiaba de entrenador por Rafael Arutyunyan y que se trasladaba a Estados Unidos para vivir y entrenar a tiempo completo.
Temporada 2018-19Editar
Honda comenzó su temporada en septiembre en el CS Nebelhorn Trophy 2018, donde quedó sexta. En octubre, compitió en su primer evento de Gran Premio de la temporada, 2018 Skate America, donde fue cuarta en el programa corto y se colocó en octavo lugar en la general. Luego compitió en su segundo evento de Grand Prix en noviembre, 2018 Internationaux de France, donde fue cuarta en el programa corto y terminó sexta en la general. En los Campeonatos Nacionales de Japón de 2018, en diciembre, fue decimoctava tras el programa corto y se colocó decimoquinta en la general.
Temporada 2019-20Editar
Honda comenzó la temporada en el Trofeo CS Nebelhorn 2019, donde se colocó quinta. Inicialmente asignada a un solo Gran Premio, Honda se incorporó posteriormente a la lista del Skate Canada International 2019 tras la retirada de Mai Mihara. Mientras viajaba desde la arena de Kelowna, ella y su compañero japonés Keiji Tanaka se vieron involucrados en un accidente de coche. Honda fue autorizada a competir a pesar de las lesiones en su espinilla derecha y en la frente, y llevó una férula de apoyo durante todo el tiempo, diciendo: «He decidido competir y voy a llegar hasta el final». Honda fue décima en el programa corto después de doblar un triple flip planeado y subrogar la segunda parte de su combinación de saltos, pero subió al sexto puesto después de patinar un patinaje libre más fuerte con contenido reducido. Fue séptima en la Copa de China 2019. Terminó la temporada con un octavo puesto en los Campeonatos de Japón.
Temporada 2020-21Editar
Honda se retiró del Open de Japón tras dislocarse el hombro. Compitió en los Seccionales del Este, quedando en décimo lugar. Asignada al Grand Prix en el Trofeo NHK 2020, quedó novena. Honda se situó en décimo lugar en las Secciones Orientales y se clasificó para los Campeonatos de Japón. Sin embargo, se retiró de los Campeonatos tras sufrir un colapso por mareos antes de un entrenamiento matutino en el evento.