Honda begyndte at skøjte i en alder af to år efter at have fulgt sin storebror, Taichi, til kunstskøjteløb.
Med start i sæsonen 2011-12 stod Honda på podiet ved fire japanske novice-mesterskaber i træk, med en guldmedalje i 2012-13. Hun blev inviteret til at skøjte i galla ved World Team Trophy i samme sæson. Hun blev nummer 5 ved de japanske juniormesterskaber i 2013-14 og nummer 4 i den følgende sæson, hvor hun trænede på Kansai University Middle Schools skøjtebane. Som sølvmedaljevinder ved de japanske novice-nationsmesterskaber i 2014 blev hun inviteret til at skøjte i gallaen ved NHK Trophy i 2014. Hendes Lutz og flip er hæmmet af hallux valgus.
2015-16 sæson: JuniorverdensmesterRediger
Honda debuterede på ISU Junior Grand Prix (JGP) i 2015-16-sæsonen. Som nummer et i det korte program og nummer fire i friis kom hun med sølvmedaljen ved JGP i Colorado Springs, Colorado, efter at have sluttet bag Yuna Shiraiwa med en margin på 8,06 point. Hun vandt guld ved sit andet JGP-stævne i Zagreb, Kroatien, efter at hun blev nummer tre i det korte program og nummer et i det frie program – med 6,16 point foran Wakaba Higuchi. Disse resultater kvalificerede hende til JGP-finalen i 2015-16 i Barcelona. I november blev Honda nummer seks ved de japanske juniormesterskaber 2015-16.
Ved JGP-finalen 2015-16 i Barcelona vandt Honda bronze bag Ruslands Polina Tsurskaya og Maria Sotskova.
I sin debut ved de japanske mesterskaber på seniorniveau sluttede Honda på en niendeplads og blev udpeget på Japans hold til juniorverdensmesterskaberne 2016 i Debrecen. Som nummer to i det korte program og nummer et i friis blev hun tildelt guld i Ungarn foran Ruslands Maria Sotskova og holdkammeraten Wakaba Higuchi.
2016-17 sæsonRediger
Honda begyndte sin sæson med en guldmedalje ved Asian Trophy 2016. Hun blev udtaget til JGP-stævnerne i Japan og Slovenien. I sit første stævne ved JGP Yokohama placerede hun sig som nummer fem i det korte program og vandt fristilen med en juniorverdensrekord på 128,64 point for at blive nummer to i den samlede stilling. I sit næste stævne ved JGP Ljubljana vandt hun endnu en sølvmedalje og kvalificerede sig dermed til sin anden JGP-finale. Hun trak sig dog tilbage fra finalen med henvisning til sygdom. I november vandt hun bronze ved Japans nationale juniormesterskaber.
Hun blev samlet set nummer fire ved sit andet japanske nationale seniormesterskab og blev udpeget til at deltage ved juniorverdensmesterskaberne i Taipei i 2017. Hun blev nummer to i begge segmenter, satte nye personlige rekorder og blev tildelt sølvmedaljen bag guldvinderen Alina Zagitova og foran bronzemedaljevinderen Kaori Sakamoto. Hun blev inviteret til at skøjte i galla ved World Team Trophy 2017.
2017-18 sæson: SeniordebutRediger
Honda indledte sin seniordebut med en guldmedalje ved US Classic 2017 i Salt Lake City. Hun deltog i sin første holdkonkurrence ved Japan Open og vandt sølvmedalje med sine holdkammerater.
Honda fik sin senior Grand Prix-debut ved Skate Canada 2017. Hun blev nummer ti i det korte program efter at være faldet i sin triple Lutz-triple toe-kombination og have knækket sin planlagte double Axel til en single, men det lykkedes hende at placere sig på tredjepladsen i fri skate for at blive samlet nummer fem. I sin næste begivenhed ved Cup of China 2017 placerede hun sig som nummer seks i det korte program og som nummer fem i fri skate for at blive nummer fem samlet set. Ved Japan Nationals 2017-18 i Japan blev hun sjette i det korte program og niende i fri skate, hvilket gav hende en samlet syvendeplads. Senere deltog hun ved Challenge Cup 2018, hvor hun blev nummer elleve efter det korte program. Hun placerede sig som nummer to i fri skate og vandt bronzemedalje.
Den 30. marts meddelte hun, at hun skiftede træner til Rafael Arutyunyan og flyttede til USA for at bo og træne på fuld tid.
2018-19 sæsonRediger
Honda begyndte sin sæson i september ved 2018 CS Nebelhorn Trophy, hvor hun placerede sig som nummer seks. I oktober deltog hun i sit første Grand Prix-stævne i sæsonen, 2018 Skate America, hvor hun blev nummer fire i det korte program og blev nummer otte i alt. Derefter deltog hun ved sin anden Grand Prix-begivenhed i november, 2018 Internationaux de France, hvor hun placerede sig som nummer fire i det korte program og sluttede som nummer seks samlet set. Ved de japanske nationale mesterskaber 2018 i december blev hun attende efter det korte program og femtende samlet set.
2019-20 sæsonRediger
Honda indledte sæsonen ved CS Nebelhorn Trophy 2019, hvor hun placerede sig som nummer fem. Honda blev oprindeligt kun tildelt ét Grand Prix, men blev efterfølgende tilføjet til 2019 Skate Canada International-listen efter Mai Mihara’s tilbagetrækning. Under rejsen fra arenaen i Kelowna var hun og den japanske skøjteløberkollega Keiji Tanaka involveret i en bilulykke. Honda blev godkendt til at konkurrere på trods af skader på sit højre skinneben og sin pande og bar en støttebøjle hele tiden og sagde: “Jeg besluttede mig for at konkurrere, og jeg går hele vejen til slutningen.” Honda blev nummer ti i det korte program efter at have fordoblet en planlagt triple flip og underroteret den anden del af sin springkombination, men steg til sjettepladsen efter at have skøjtet en stærkere friløb med et nedskaleret indhold. Hun blev syvende ved Cup of China i 2019. Hun sluttede sæsonen med en ottendeplads ved de japanske mesterskaber.
2020-21 sæsonRediger
Honda trak sig tilbage fra Japan Open efter at have forstuvet sin skulder. Hun deltog ved Eastern Sectionals og placerede sig på tiendepladsen. Hun blev udtaget til Grand Prix ved NHK Trophy 2020 og placerede sig som niende. Honda placerede sig som nummer ti ved Eastern Sectionals for at kvalificere sig til de japanske mesterskaber. Hun trak sig dog fra mesterskaberne efter at være kollapset af svimmelhed forud for en morgentræning ved arrangementet.