Nevíme, co se stalo.
Víme, co se nestalo. Oblíbená fanouškovská teorie říká, že došlo k nějakému kataklyzmatu, při kterém se Zero utrhl ze řetězu a všechny zabil. To bylo samotným Keiji Inafunem výslovně zamítnuto.
Wily podle všeho přežil díky viru Maverick a rozhodně je to on, kdo ho a Zera stvořil. Přinejmenším o tom není pochyb.
Pokud bych měl hádat:Roll pravděpodobně skončil opotřebovaný později.
Blues/Protoman pravděpodobně zemřel kvůli své energetické nevyváženosti.
Je pravděpodobné, že se Megaman a Forte/Bass nakonec zabili navzájem.
Lightovi ve flashbacích ze Dne Sigmy očividně selhávalo zdraví, takže je pravděpodobné, že prostě zemřel přirozenou smrtí.
Je silně naznačeno, ale nikdy nebylo potvrzeno, že Wily nahrál svou mysl do počítače.
Alternativní osud Megamana by mohl být tento: Jedním z robotích mistrů doktora Wilyho je Quint, přeprogramovaná verze Megamana, kterého Wily ukradl před 34 lety v budoucnosti. V té době Megamanův boj skončil a byly mu odstraněny bojové části, takže mu Wily dal nové ve snaze zabít jeho minulé já. Megaman ho samozřejmě porazil, ale, a to vycházím z paměti, nemám to vůbec ničím podložené, jsem si docela jistý, že Quint ve skutečnosti zničen nebyl.
Nejsem si jistý, co se tam stalo.