První podzemní kamenné doly se začaly objevovat v 19. století, zatímco v Oděse probíhala čilá výstavba. Byly využívány jako zdroj levného stavebního materiálu. Vápenec se řezal pomocí pil a těžba byla tak intenzivní, že ve druhé polovině 19. století rozsáhlá síť katakomb způsobila městu mnoho nepříjemností.

Vchod do katakomb v Moldavance na Kartamyševské ulici. Vchody do katakomb musí být neustále uzavřeny nebo kontrolovány, aby se zabránilo vstupu dětí.

Po ruské revoluci v roce 1917 byla těžba kamene v centrální části Oděsy (uvnitř zóny Porto-Franko, ohraničené ulicemi Starý přístav Franko a Pantělejmonovská) zakázána.

Za druhé světové války sloužily katakomby jako úkryt sovětských partyzánů, zejména oddílu Vladimira Molodcova. Valentin Katajev ve svém díle Vlny Černého moře popsal boj sovětských partyzánů proti vojskům Osy pod Oděsou a jejím nedalekým předměstím Usatove.

V roce 1961 vznikl klub „Hledání“ (Poisk), který se zabývá historií partyzánského pohybu mezi katakombami. Od svého vzniku rozšířil znalosti o katakombách a poskytl informace pro rozšíření mapování tunelů.

Město má velký počet obyvatel (přes 1 milion), kterým by podle některých názorů prospělo zavedení metra. Tunely jsou uváděny jako důvod, proč takový systém metra nebyl v Oděse nikdy vybudován.

Od počátku 21. století pokračuje těžba vápence v dolech nacházejících se v Dofinovce, Byldynce a „Fomina balka“ u Oděsy. V důsledku současné těžby se katakomby nadále rozšiřují.