Nemoci, na které se vztahuje NPIP, jsou ptačí chřipka (mor drůbeže) a nemoci vyvolané S. pullorum (pullorum disease), S. gallinarum (tyfus drůbeže), S. enterica var. enteritidis, Mycoplasma gallisepticum (MG, chronické respirační onemocnění a infekční sinusitida u krůt), M. synoviae (MS, infekční synovitida) a M. meleagridis (MM, jednodenní airsacculitis). Kromě toho má NPIP programy jako „U.S. Salmonella Monitored“ a „U.S. Sanitation Monitored“, jejichž cílem je snížit výskyt salmonelových organismů v násadových vejcích, kuřatech a drůbeži prostřednictvím účinných a praktických sanitačních postupů v chovu a líhni.

Drůbež je v NPIP definována jako domestikovaná drůbež, včetně kuřat, krůt, pštrosů, emu, rejsců, kasuárů, vodního ptactva a pernaté zvěře (kromě holubů a holubů), která je chována především za účelem produkce vajec a masa. Do NPIP jsou zapojeny tři typy účastníků: nezávislá hejna, líhně a obchodníci. Drůbežími produkty certifikovanými v rámci NPIP jsou násadová vejce, malá kuřata, drůbež a kuřice. Převážná většina států USA zakazuje vstup jakýchkoli zásilek drůbeže s výjimkou těch, které jsou označeny jako čisté od tyfu pullorum. Tyto zákazy v podstatě znamenají, že drůbež přepravovaná mezi státy by se měla účastnit programu NPIP „U.S. Pullorum-Typhoid Clean“ nebo být před opuštěním domovského státu testována na pullorum-tyfus s negativním výsledkem. Patnáct států vyžaduje, aby všechny zásilky krůt, které obdrží, byly MG čisté. Tento požadavek v podstatě znamená, že krůty přepravované mezi státy by se měly účastnit programu NPIP „U.S. MG Clean“ nebo být před odesláním testovány na přítomnost MG.

Většina obchodních partnerů USA dovážejících drůbež a produkty ze Spojených států rovněž vyžaduje účast v NPIP. Akreditovaní veterinární lékaři mohou být požádáni, aby kontrolovali chovatelská hejna zapojená do NPIP z hlediska dodržování standardů a vydávali veterinární osvědčení. Každé jaro APHIS zveřejňuje adresář účastníků, kteří nakládají s kuřaty a krůtami vaječného a masného typu, a adresář účastníků, kteří nakládají s vodní drůbeží, výstavní drůbeží, pernatou zvěří a ptáky nadřádu běžci. V těchto adresářích jsou uvedeny líhně, nezávislá hejna a obchodníci, kteří se účastní NPIP, produkty, s nimiž nakládají, a klasifikace nákaz, jichž se účastní.