V bioinformatice je miRBase biologická databáze, která slouží jako archiv sekvencí a anotací mikroRNA. K září 2010 obsahovala informace o 15 172 mikroRNA. Do března 2018 se tento počet zvýšil na 38 589. Registr miRBase poskytuje centralizovaný systém pro přiřazování nových názvů genům mikroRNA.

miRBase

Content

Description

microRNA database

Contact

Research center

University of Manchester

Autoři

Ana Kozomara

Primární citace

Kozomara & al. (2011)

Datum vydání

Přístup

Stránky

www.mirbase.org

miRBase vyrostla ze zdroje registru mikroRNA, který v roce 2003 založil Sam Griffiths-Jones.

Podle Anny Kozomary a Sama Griffithse-Jonese má miRBase pět cílů:

1. poskytnout konzistentní systém pojmenování mikroRNA
2. poskytnout centrální místo shromažďující všechny známé sekvence mikroRNA
3. poskytnout lidsky i počítačově čitelné informace pro každou mikroRNA
4. Poskytnout primární důkazy pro každou mikroRNA
5. Shromáždit a propojit informace o cílech mikroRNA

MiRBase obsahuje miRNA patřící různým druhům patřícím do Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae a Viruses. Pro Viridiplantae jsou ve verzi 21 (2014) k dispozici údaje pro 73 druhů. To zahrnuje 4800 unikátních zralých miRNA a 8480 prekurzorových sekvencí.

Aktuální verze databáze MiRBase je vydání 22 (březen 2018).

.