Metyrapon lze použít při diagnostice nedostatečnosti nadledvin. Metyrapon 30 mg/kg, maximální dávka 3 000 mg, se podává o půlnoci obvykle se svačinou. Plazmatický kortizol a 11-deoxykortizol se měří následující ráno mezi 8:00 a 9:00 hodinou. Plazmatický kortizol nižší než 220 nmol/l znamená dostatečnou inhibici 11β-hydroxylázy. U pacientů s neporušenou osou Hypotalamo-hypofýza-nadledviny stoupá hladina CRH a ACTH jako odpověď na klesající hladinu kortizolu. To má za následek zvýšení steroidních prekurzorů v dráze. Pokud tedy hladina 11-deoxykortisolu nestoupá a zůstává nižší než 7 µg/dl (202 nmol/l) a adrenokortikotropní hormon (ACTH) stoupá, pak to vysoce nasvědčuje adrenální insuficienci. Pokud se 11-deoxykortizol ani ACTH nezvýší, vysoce to svědčí pro poruchu osy hypotalamus-hypofýza-nadledviny buď na hypofýze, nebo na hypotalamu.

Metyraponový test může pomoci při ověřování příčiny Cushingova syndromu. U většiny pacientů s dysfunkcí hypofýzy a/nebo mikroadenomem hypofýzy se sekrece ACTH v reakci na metyrapon zvýší, zatímco u většiny ektopických nádorů produkujících ACTH nikoli. Makroadenomy hypofýzy na metyrapon nereagují vždy.

Metyrapon se používá k léčebné kontrole hyperkortizolismu u Cushingova syndromu (ACTH dependentního nebo nezávislého). Cílem medikamentózní léčby je dosažení předoperační kontroly hyperkortizolismu nebo kontrola reziduálního onemocnění přetrvávajícího po operaci (TSS, adrenalektomie). Neslouží k dlouhodobé definitivní léčbě/vyléčení, pouze jako doplněk (u většiny příčin Cushingova syndromu je cílem vyléčení operace). Metyrapon tedy působí inhibicí steroidogeneze nadledvin. Jedním z vedlejších účinků je hirsutismus (u žen) kvůli nadbytku vytvořených prekurzorů androgenů. Dalším běžně používaným přípravkem pro medikamentózní léčbu Cushingova syndromu je ketokonazol (protiplísňový přípravek). Ten nevykazuje vedlejší účinek hirsutismu.