Stejně jako zbytek Středoamerického průlivu to Honduras neměl jednoduché. Má za sebou násilnou a bouřlivou historii.

Příběh života v Hondurasu začíná již v době, kdy lidé migrovali ze Severní Ameriky dolů do Jižní Ameriky a využívali Střední Ameriku jako pevninský most. Po cestě mnozí z nich nakonec zůstali. Artefakty nalezené po celé oblasti ukazují, že lidé v ní byli mezi 12 000 a 8 000 lety př. n. l.

Po několik dalších tisíc let byl Honduras domovem různých kmenů různých etnik rozesetých po celé zemi. Do roku 150 n. l. se mayská civilizace uchytila v oblastech na sever a západ od Hondurasu – v Guatemale, Mexiku a Belize.

Mayové se rozšířili do západního Hondurasu a založili město Copan. Copan a západní Honduras označovaly rozsah mayského areálu od jeho srdce. To však nebránilo tomu, aby se stal významným centrem mayského světa.

Bylo to v předklasickém období, 2000 př. n. l. až 200 n. l., kdy Mayové poprvé přišli do západního Hondurasu. Copan se však prosadil až v klasickém období. Přibližně mezi lety 400 n. l. a 800 n. l. byl Copan na svém vrcholu jako bezkonkurenční hlava mayského království.

Od roku 800 n. l. město upadalo. Vládnoucí elita Copan opustila a město se postupně měnilo v ruinu, protože lidé kradli kameny pro vlastní stavby. Osud Copanu byl mikroverzí osudu celé mayské civilizace.

Většina Hondurasu nebyla pod mayskou kontrolou, ačkoli sousední národy a kmeny s Copanem obchodovaly a bojovaly. Staletí po kopanském úpadku, která vedla až k příchodu Španělů, probíhala v neznámu, protože každý národ se věnoval svým záležitostem.

Veškeré dění se navždy změnilo 30. července 1502. Tehdy Kryštof Kolumbus na své čtvrté a poslední cestě do Nového světa přistál na ostrově Guanaja, jednom z ostrovů v Honduraském zálivu. Byl prvním Evropanem, který dosáhl Střední Ameriky.

O několik týdnů později, 14. srpna, se Kolumbus stal prvním Evropanem, který vkročil na středoamerickou pevninu, nedaleko města Trujillo. Kolumbus tuto zemi pojmenoval Honduras, což znamená „hlubiny“. Předpokládá se, že měl na mysli hlubiny vod u pobřeží.

Kolumbus se v Hondurasu dlouho nezdržel. Zamířil na východ podél pobřeží a dolů, aby prozkoumal Nikaraguu, Kostariku a Panamu a poté se vrátil do Santo Dominga. Pevninská část Ameriky byla nyní v hledáčku Španělů.

Když Španělé během následujících dvaceti let dobyli Aztéky v Mexiku na severu a probojovali se z Panamy na jih, bylo zřejmé, že se všichni někde setkají. Tím místem byl Honduras, který se stal dějištěm bojů soupeřících španělských conquistadorů ze všech různých směrů mezi sebou i s domorodým obyvatelstvem, aby získali kontrolu nad zemí.

Gil Gonzales Davila dorazil ze severního pobřeží a doufal, že se dostane zpět dolů k Nikaragui, kterou již dobyl. Mezitím Hernan Cortés, čerstvě po dobytí Mexika, hledal nové výzvy. Cortes vyslal Cristobala de Olid do Hondurasu ze západu. Ve hře byl také Francisco Hernandez de Cordoba, který přišel z Nikaraguy, kterou rovněž dobyl v soupeření s Davilou. Nikdo z těchto mužů se neměl příliš v lásce a všichni chtěli Honduras pro sebe.

Olid, Cortesův muž, se v Hondurasu pustil do lumpáren a snažil se získat zemi pro sebe, a ne pro španělskou korunu. To znamenalo, že Cortes dorazil s vlastními silami. Nyní byly v Hondurasu čtyři konkurenční španělské síly, které mezi sebou bojovaly mezi dobýváním místních obyvatel. Po mnoha potyčkách, které hraničily s otevřenou občanskou válkou mezi Španěly, byl Olid nakonec popraven. Zprostředkovatelé vyslaní ze Santo Dominga pomohli v roce 1525 upevnit španělskou přítomnost pod Cortesovým vedením.

Když Cortes ovládl Španěly v Hondurasu, věci se daly rychle do pohybu. V roce 1525 bylo založeno město Trujillo a brzy poté do země dorazil Cortes z Mexika. Jeho příjezd byl pro španělské vojáky a osadníky v Hondurasu povzbuzením. Od té doby až do roku 1539 probíhalo dobývání pro Španěly hladčeji.

V roce 1539 byl Honduras součástí španělské říše pod kontrolou Generálního kapitanátu Guatemala.

Jako součást Generálního kapitanátu byl Honduras důležitý. Na rozdíl od většiny ostatních částí Střední Ameriky, kde Španělé nenašli žádný poklad, se v Hondurasu nacházelo stříbro.

Domorodí obyvatelé z celé Střední Ameriky přicházeli (ne z vlastní vůle) pracovat do dolů, stejně jako později otroci z Afriky. Honduras ve srovnání se zbytkem Střední Ameriky docela zbohatl a v roce 1578 bylo v hornické oblasti založeno město Tegucigalpa.

Španělská vláda se vždy soustředila kolem oblastí těžby stříbra, ve středu Hondurasu, daleko od karibského pobřeží. Jak stříbrné doly nabývaly na významu, Španělé se přesouvali do vnitrozemí a pobřeží nechávali bez ochrany. Popravdě řečeno, přestože Španělé dorazili na karibské pobřeží od samého počátku, po zahájení dobývání se jednalo o oblast, kterou se jim nikdy nepodařilo zcela ovládnout. Tato část Hondurasu, včetně Bay Islands, se dostala pod menší vliv Španělů.

Jak se Španělé stěhovali, stěhovali se jiní, a to v podobě pirátů, kteří víceméně převzali kontrolu na Bay Islands, které využívali jako základnu. Do hry vstoupili také Britové, kteří podporovali kmen Miskito proti Španělům.

Španělsko si Miskito nikdy nepodmanilo. Jakmile se spojili s Brity, otevřelo to Britům cestu k ovládnutí celého karibského pobřeží Střední Ameriky. Jednalo se o oblast zvanou Pobřeží Moskytů.

V roce 1821 získalo Mexiko nezávislost na Španělsku a s ní i Generální kapitanát Guatemala, jehož součástí byl i Honduras. Dva roky poté se Generální kapitanát od Mexika odtrhl a Střední Amerika se do toho pustila sama.

Společná republika Střední Amerika sama o sobě příliš dlouho nevydržela. Po několika letech zmatků se v roce 1839 rozpadla a jednotlivé její provincie se osamostatnily. Honduras byl nyní suverénním státem.

Ironií osamostatnění Hondurasu byla skutečnost, že ze všech zemí Střední Ameriky to byl právě Honduras, kdo nejvíce prosazoval, aby Střední Amerika zůstala pohromadě.

I po získání nezávislosti se Honduras mnohokrát snažil přimět ostatní země ke sjednocení, ale marně. Pět hvězd na honduraské vlajce, po jedné pro každou zemi, svědčí o tom, že se Honduras vnímal spíše jako součást větší Střední Ameriky než jako samostatná země. Tím je v regionu jedinečný.

Ale Honduras byl sám, ať se nám to líbí, nebo ne. Začal si určovat svůj vlastní směr.

Jednou z prvních věcí, kterou Honduras během prvních několika desetiletí své existence udělal, bylo pozvání zahraničních investic, aby pomohly vybudovat jeho ekonomiku. Zahraniční společnosti z Evropy a Spojených států přišly do Hondurasu a začaly stavět železnice a přepravovat ovoce.

Na počátku 20. století Honduras přenechal rozsáhlé plochy své půdy velkým společnostem, jako je United Fruit, výměnou za pracovní sílu, kterou poskytly, a infrastrukturu, kterou vybudovaly.

Tyto ovocnářské společnosti se staly natolik vlivnými ve všech aspektech honduraského života, že byl Honduras nazýván první skutečnou „banánovou republikou“. Tyto společnosti ovládaly honduraské prezidenty a politiky. Země byla v podstatě oligarchií.

Práva pracujících byla v Hondurasu minimální, protože pro ovocnářské společnosti byl důležitý zisk. Reformy byly schváleny a pak zrušeny a znovu schváleny.

Když dělníci v 50. letech získali právo organizovat se, vedla masivní generální stávka ke svržení demokraticky zvoleného prezidenta Villeda Moralese, který sympatizoval s dělníky, armádou podporovanou společností United Fruit, která v zemi zavedla diktaturu trvající až do začátku 80. let.

Během diktatury Honduras potlačoval práva dělníků a levicových skupin. Reformy, které Morales provedl ve prospěch zaměstnanců United Fruit, pozbyly platnosti. Odbory trpěly šikanou.

Honduraská vojenská vláda se stala věrným spojencem Spojených států v boji proti komunismu v Latinské Americe.

V roce 1969 vedl Honduras krátkou, ale krvavou válku se Salvadorem, nazývanou fotbalová válka, protože se shodovala s některými kvalifikačními zápasy na mistrovství světa ve fotbale mezi oběma zeměmi. Skutečným důvodem byla skutečnost, že v Hondurasu žilo mnoho salvadorských přistěhovalců, které lákala práce v ovocnářských podnicích.

Když se ekonomika ocitla v problémech, chtěla vojenská vláda najít obětního beránka, a tak obvinila přistěhovalce. Salvador reagoval a v červenci 1969 začala čtyřdenní válka. Ačkoli válka skončila nerozhodně, znamenala zlom v osudech vojenské vlády. Mnoho lidí, kteří ji dříve podporovali, nyní obrátilo. Vznikly skutečné opoziční strany a sedmdesátá léta se stala desetiletím postupných reforem, po nichž následoval neúspěch a po něm postupné reformy. Drobné krůčky.

V roce 1981 se do Hondurasu vrátila civilní vláda. Byla sepsána nová ústava a ovocnářské společnosti, jejichž rozkvět již dávno skončil, se ocitly bez jakékoliv moci. S pomocí pomoci z celého světa se Honduras začal reformovat. Během této doby se Honduras stal největší cílovou zemí pro Mírovou korporaci.

V 80. letech však nebylo vše růžové. Nová vláda se obávala, že se Honduras dostane pod komunistickou kontrolu podobně jako sousední Nikaragua. Jeho další sousedé Guatemala a Salvador se také sami zmítali v občanských válkách a Honduras nechtěl jít touto cestou.

Stejně tak Spojené státy nechtěly na Isthmu další levicový režim.

Honduraská armáda, přestože nebyla u moci, přesto zahájila malé zastrašovací kampaně proti levicovým skupinám v zemi, včetně použití eskader smrti.

Mírové dohody, které ukončily občanské války ve Střední Americe, z větší části ukončily represe i v Hondurasu.

V roce 1998 byla země prakticky zničena hurikánem Mitch, který zničil asi 70 % honduraského zemědělství a 80 % infrastruktury. Říkalo se, že 50 let pokroku v Hondurasu bylo zvráceno a země se vrátila do 40. let 20. století.

Od té doby se Honduras obnovuje. Situace se zhoršila v roce 2009, kdy byl tehdejší prezident Manuel Zelaya svržen za pokus o změnu ústavy, která by mu umožnila znovu kandidovat. Na krátkou dobu převzala moc armáda, než ji předala zpět do rukou lidu.