Úvod

Ve všech organismech se vyskytuje řada genů, které porušují předpoklad rovnoměrného přenosu a místo toho sobecky zvyšují svou frekvenci v následujících generacích (tzv. drive) na úkor genomu jako celku. Takové sobecké geny mohou tvořit podstatnou část genomu a vykazují řadu strategií pro zvýšení svého šíření . Některé genové drivy jsou narušiteli přenosu, které se zaměřují na gametogenezi, aby zajistily jejich nadměrné zastoupení ve vajíčkách nebo spermiích po meióze, což vede k účinnému narušení přenosu. Takové meiotické drivery byly poprvé popsány téměř před sto lety a byly charakterizovány u rostlin, hmyzu a savců . Mohou být autozomální (např. t haplotyp u myši domácí Mus musculus, který se přenáší ze samců až na 100 % potomků-) nebo spojené s jedním z pohlavních chromozomů, což vede k narušení poměru pohlaví (např. SR u mušek, způsobující až 100% dcer ). Nedávno byly vyvinuty syntetické genové pohony, které dosahují podobných výsledků – přenášejí se téměř na všechny potomky. Pokud se podaří zkonstruovat syntetické genové pohony a vložit je do populací škůdců, mohou se rychle rozšířit a potenciálně narušit funkci životně důležitého genu, což povede k vymření populace nebo k přeměně celé populace na samčí . Alternativně by genový pohon mohl nést balíček genů, jehož cílem by bylo trvale modifikovat cílovou populaci. Možné modifikace zahrnují znemožnění komárů přenášet malárii nebo zvýšení jejich zranitelnosti vůči pesticidům.

Potenciál využití systémů genového pohonu při kontrole velkých škůdců byl přijat s nadšením i skepsí. Tento přístup byl vychvalován jako revoluční a účinný mechanismus kontroly chorob přenášených hmyzem a škůdců plodin, který je vysoce cílený a potenciálně výrazně levnější než konvenční metody, jako jsou pesticidy . Existuje však řada překážek, jak technických, tak etických, které brání zavedení této techniky ve volně žijících populacích. Chceme-li předvídat výsledky uvolňování syntetických pohonů, musíme naléhavě pochopit, jak se přirozené pohonné systémy šíří populacemi. Jednou z klíčových překážek je riziko, že se u cílových populací rychle vyvine schopnost potlačit pohonný systém, čímž se stane neúčinným, jak bylo pozorováno u přírodních pohonných systémů . Kolik toho tedy v současné době víme o dynamice genových pohonů?“

Obsah zvláštního čísla

Toto zvláštní číslo obsahuje 14 příspěvků, které pokrývají širokou škálu aspektů přirozených a syntetických genových pohonů u řady živočišných a rostlinných druhů. Níže je představujeme a diskutujeme seskupené do tří širokých témat: (i) syntetické systémy pohonu, (ii) přirozené systémy pohonu a (iii) úspěšnost implementace a širší etické aspekty genových pohonů.

(a) Syntetické systémy pohonu

The Special Feature begins with two reviews. První z nich, Ritchie & Staunton , se zamýšlí nad poučením z dvacetileté účasti na nejpokročilejším programu zásahů genových pohonů: použití endosymbionta Wolbachia k potlačení přenosu virů komáry. Diskutují o historii kontroly komárů, od pesticidů přes přirozené nepřátele až po vypouštění sterilních samců, a o omezeních těchto přístupů, která vedla k naléhavé potřebě účinnějších řešení. Poté diskutují o objevu kmene nitrobuněčného parazita Wolbachia, který po vložení do komárů Aedes aegypti snižuje přenos horečky dengue na člověka. Tento kmen Wolbachie se v populacích komárů šíří pomocí cytoplazmatické inkompatibility: vajíčka neinfikovaných samic nemohou být oplodněna při páření se samci infikovanými Wolbachií, ale vajíčka infikovaných samic mohou být oplodněna infikovanými i neinfikovanými samci, což infikovaným samicím poskytuje fitness výhodu. Od vypuštění těchto komárů v australském Cairns se město zbavilo horečky dengue, což z něj činí dosud nejúspěšnější zásah genového pohonu.

Druhý přehled, jehož autory jsou Barrett a kol. , se zaměřuje na genový pohon u rostlin; oblast, v níž bylo provedeno poměrně málo prací s genovým pohonem. Shrnují mnoho klíčových možností a otázek a diskutují strategie využití syntetického genového pohonu ke zlepšení kontroly plevelů. Jedním z klíčových přístupů je přímé potlačování populací hubením cílových druhů rostlin. Naznačují však, že užitečnějším přístupem může být modifikace, která činí plevelné druhy zranitelnějšími vůči tradičním technikám kontroly, jako jsou pesticidy. Pro zemědělské využití to má obrovský potenciál, protože to omezuje hubící účinek ovladače na populace, na které jsou pesticidy zaměřeny, a radikálně snižuje jakýkoli dopad ovladače na necílové populace. Dalším zajímavým využitím je posílení přežití ohrožených druhů rostlin tím, že se do zranitelných populací vnesou specifické užitečné geny, jako je například odolnost vůči suchu. V přehledu je zejména zdůrazněna problematika uchovávání semen, dlouhodobého přetrvávání semen v půdě. Barrett a kol. ukazují, že banka semen může zpomalit šíření genového pohonu tím, že funguje jako zásobárna semen divokého typu. Tato problematika je do značné míry jedinečná pro rostliny, i když by snad mohla být aplikovatelná i na živočichy s kryptobiotickou fází, jako jsou tardigrádi, hlístice a rotifers.

Beaghton et al. se zaměřují na genový drive konverze, jehož konstrukce se stala relativně snadnou díky nástupu CRISPR/Cas9. Tento typ pohonu využívá syntetický nukleázový driver, který se kopíruje na homologní chromozomy, což umožňuje jeho rychlé šíření populací. Pokud pohon naruší klíčový gen související s plodností, může jeho šíření radikálně snížit produktivitu populace. Tento článek se zaměřuje na problematiku nefunkční rezistence u cílových genů. Modelování a praktické experimenty (např. Oberhofer et al. ) zjistily, že cílový gen se může rychle vyvinout tak, že je pro ovladač nerozpoznatelný, což zabrání přeměně genu a umožní této rezistentní alele udržet v populaci funkční verze cílového genu. Nedoceněným problémem však je, že mutace mohou také vytvořit nerozpoznatelné cílové alely bez zachování funkce cílového genu. Dříve byla tato možnost do značné míry přehlížena, protože nefunkční rezistentní alely stále vedou k tomu, že se geny v populaci stále více poškozují. Zde však Beaghton a kol. poukazují na to, že mechanismus pohonu má obvykle své náklady. Nefunkční rezistentní alely nenesou náklady pohonu a jsou imunní vůči přeměně genů, takže se mohou potenciálně šířit populacemi obsahujícími pohon, což snižuje šíření pohonu. To je skvělá ilustrace toho, jak je důležité, aby se modelování a empirická práce při navrhování a používání syntetického pohonu vzájemně úzce informovaly.

Další článek, jehož autorem je Holman , rovněž modeluje zajímavou, ale neprozkoumanou oblast genového pohonu, a to potenciální použití syntetických meiotických ovladačů u druhů se systémy determinace pohlaví ZW. U ZW organismů, jako jsou motýli a ptáci, mají samice heterozygotní pohlavní chromozomy. Model naznačuje, že ovladače s chromozomy Z, jejichž nositelky produkují pouze syny, by se měly šířit extrémně rychle, pokud se podaří zabránit evoluci rezistence. Tento model je významným krokem vpřed ve vývoji genových pohonů pro neprozkoumané druhy škůdců ZW, včetně trematodů, kteří způsobují schistosomózu, a závažných zemědělských škůdců z řádu Lepidoptera.

Existuje také reálný zájem o využití syntetického genového pohonu jako ochranářského opatření pro kontrolu invazních druhů, jako jsou krysy a myši, které způsobily vážný úbytek mnoha zranitelných endemických populací ptáků, savců a ještěrů. Godwin a kol. podávají přehled o možnostech využití genových pohonů ke kontrole populací škodlivých hlodavců. Uvažují o navrhovaných systémech pohonu založených na homologicky řízených opravách CRISPR (které zatím nebyly u myší spolehlivě funkční ) a také o modifikaci rozšířeného starobylého systému pohonu myši domácí, haplotypu t, na ovladač poměru pohlaví. Výhodou kooptace starobylého systému pohonu, v němž nebyly nalezeny supresory, je, že rychlá evoluce rezistence může být menším problémem. Manser a spol. dále zkoumají tento syntetický ovladač založený na t haplotypu, který je ve vývoji. Haplotyp t je autozomální ovladač zabíjející spermie, který manipuluje se spermiemi tak, že téměř všichni potomci heterozygotního samce zdědí haplotyp t. Haplotyp t je také autozomální ovladač. Cílem projektu t-Sry je vzít klíčový savčí gen pro určení pohlaví Sry z myšího chromozomu Y a vložit jej na haplotyp t na chromozomu 17, a vytvořit tak „t-Sry“, autozomální genový pohon, který změní všechny jedince, kteří jej zdědí, na samce. Záměrem je zavést t-Sry do populací ostrovních myších škůdců, čímž se celá populace změní na samce a zcela se eliminuje . Manser a kol. zkoumají populační dynamiku systému t-Sry. Modelují zavedení t-Sry na ostrovy, kde samice myší mají různou míru polyandrie (vícenásobného páření). Protože haplotyp t poškozuje spermie, mají nositelé špatný úspěch, když se samice, s nimiž se páří, páří také s divokými samci s nepoškozenými spermiemi. Manserovy modely naznačují, že populace s vysokou mírou polyandrie ztěžují šíření t-Sry a vyžadují větší úsilí při uvolňování. Vzhledem k tomu, že polyandrie je v přírodě rozšířená , mohou být tyto výsledky relevantní i pro jiné systémy pohonu, které snižují konkurenceschopnost samčích spermií.

Godwin a kol. dále upozorňují na některé klíčové biologické, regulační a bezpečnostní problémy při používání genových pohonů u myší. Biologie, ekologie a chování cílových populací ostrovních hlodavců zůstávají nedostatečně prozkoumány. Přinejmenším stejně důležité je, že navazují na Ritchieho & Stauntona a George et al. a zdůrazňují, jak zásadní bude, aby regulační rámce držely krok s tempem výzkumu genových pohonů, a jak důležité je zajistit, aby dotčené komunity a zainteresované strany byly konzultovány, informovány a aby jim byla svěřena hlavní role při jakémkoli rozhodování o nasazení pohonů.

(b) Přírodní systémy pohonů

Před jakýmkoli uvolněním je pro posouzení rizik a přínosů syntetických pohonů zásadní pochopit, jak se syntetické systémy pohonů pravděpodobně rozšíří v přírodě. Studium přírodních pohonných systémů v minulém století naštěstí poskytlo značné teoretické a empirické poznatky o tom, jak pohonné systémy fungují a jak se šíří. Až donedávna nám chyběly dostatečné údaje o fitness nákladech přirozených ovladačů, abychom mohli vytvořit modely o jejich šíření v přírodě, které by dobře odpovídaly frekvencím ovladačů pozorovaným v divokých populacích.

V tomto zvláštním článku čtyři studie uvádějí fitness náklady spojené se samčími meiotickými ovladači. Tyto drivery působí během vývoje spermií, aby eliminovaly svou konkurenci, konkrétně spermie nenesoucí drivery, což podporuje jejich vlastní přenos. Finnegan et al. , Larner et al. , Dyer & Hall a Lea & Unckless měřili fitness náklady u samců a samic spojené s jejich druhově specifickým meiotickým ovladačem, a to u mouchy stonkové Teleopsis dalmanni, u ovocné mušky Drosophila pseudoobscura, u Drosophila recens a u Drosophila melanogaster, Drosophila affinis a Drosophila neotestacea. Tyto náklady na fitness se projevují jako snížená životaschopnost vajíček až do dospělosti , snížená produkce potomstva u samic a snížená úspěšnost konkurence spermií . Fitness náklady jsou však specifické pro jednotlivé znaky. Lea & Unckless nezjistil žádnou sníženou imunitní funkci spojenou se samčím meiotickým pohonem a Dyer & Hall nezjistil žádné účinky na párovací preference samic ani na dlouhověkost. Larner et al. a Dyer & Hall pak použili kvantifikované náklady fitness k parametrizaci populačně genetických modelů pro předpověď rovnovážných frekvencí v přírodě. Tyto předpovězené frekvence se blížily pozorovaným frekvencím. Jedná se o důležitý krok k pochopení dynamiky přírodních hnacích systémů, a i když se detaily budou u jednotlivých systémů lišit, souhrnně tyto studie rozšiřují povědomí o potenciálních fitness nákladech v přírodě. Systémy pohonu zkoumané v těchto čtyřech studiích leží v rozsáhlých chromozomálních přestavbách, které brání rekombinaci v rozbití kritických prvků pohonu . Zůstává neznámé, do jaké míry tyto fitness náklady vznikají pouze jako důsledek snížené rekombinace, která umožňuje akumulaci škodlivých mutací, nebo jsou pleiotropními účinky samotných pohonů.

Fitness náklady také selektují evoluci genetických supresorů pohonu. Supresory jsou přítomny ve většině pohonných systémů Drosophila , nikoli však u D. pseudoobscura. Price a kol. se zamýšlejí nad tím, proč tomu tak může být. Nízké, stabilní frekvence pohonu pozorované ve volné přírodě lze vysvětlit náklady na fitness vyplývajícími z kombinovaného účinku špatné kompetitivní schopnosti spermií SR samců a nákladů na homozygotní SR samice. Tyto fitness náklady ovlivňující dynamiku drivu však stále znamenají, že evoluce potlačení drivu by byla výhodná. Absence supresorů je proto záhadná. Tento systém pohonu u drozofil přetrvává v přírodě přinejmenším stovky tisíc let , což vede Price a spol. k otázce, zda se starobylé systémy pohonu nemohou evolučně lišit od mladších. Odhalení mechanismů, které jsou základem tohoto systému pohonu, by pomohlo objasnit, zda existují zvláštní genetická omezení, díky nimž je evoluce suprese méně pravděpodobná, a zda jsou společná i jiným starobylým systémům, u nichž se genetická suprese také nevyvinula .

Pochopení genetické architektury přírodních systémů pohonu je tedy důležité pro pochopení jejich účinků a toho, jak se pohony vyvinuly, ale také může pomoci při návrhu syntetických pohonů. Naváděcí endonukleázové pohonné systémy byly popsány u kvasinek a bakterií, později inspirovaly syntetické naváděcí endonukleázové pohonné systémy . Syntetický ovladač Medea vyvinutý pro škůdce plodin Drosophila suzukii se inspiroval stejnojmenným přírodním pohonným systémem , známým z moučných brouků Tribolium . Vývoji syntetických drtičů chromozomu X u komárů předchází objev přirozeného drtiče chromozomu X u komárů , a syntetický narušitel poměru pohlaví vyvíjený u myší domácích je přímo založen na modifikaci haplotypu t . Courret a kol. podávají přehled o původu a mechanismech 19 známých ovladačů u drozofily a ukazují, že téměř všechny dobře charakterizované systémy se vyvinuly z genových duplikací a zahrnují regulaci heterochromatinu, malé RNA a/nebo jaderné transportní dráhy. Odhalení fungování těchto systémů je ztíženo jejich spojením s inverzemi, heterochromatinem a epistatickými interakcemi .

Studie genové exprese mohou pomoci určit, co prvky pohonných systémů dělají. V práci Lindholm et al. je analyzován transkriptom t haplotypu myši domácí. Nositelství jedné kopie t haplotypu změnilo ve varleti především expresi genů spermatogeneze, a to jednak genů mapujících t haplotyp, ale také většího počtu genů ve zbytku genomu. Zda je těchto transgenních regulačních účinků dosaženo transkripčními faktory, nekódující RNA, modifikací chromatinu nebo jinými procesy, není v současné době známo. V ostatních tkáních byly zjištěny menší rozdíly, které byly lokalizovány především do t haplotypu. Tato studie poukazuje na jemně odstupňovanou adaptaci ovladače na zbytek genomu nebo na rozsáhlou koadaptaci mezi nimi. Můžeme očekávat, že syntetické ovladače se budou vyvíjet tak, aby vykazovaly podobné vzorce, pokud budou mít dostatek generací?“

(c) Úspěšnost realizace a širší etické úvahy o genovém pohonu

O rizicích a přínosech využití genového pohonu jako prostředku k regulaci a potlačení populací škůdců a přenašečů ve volné přírodě – zejména komárů přenášejících malárii – se hodně diskutovalo. Genové pohony byly také navrženy jako účinný a humánní prostředek k regulaci invazních druhů, například hlodavců na ostrovech (viz také Godwin et al. ; Manser et al. v tomto čísle). Potenciální přínosy jsou impozantní: snížení rizika onemocnění přenášených hmyzem a snížení závislosti na pesticidech se všemi souvisejícími škodlivými vedlejšími účinky (jako je bioakumulace v lidské potravě nebo otrava necílových volně žijících živočichů ). Kromě toho se zvyšují náklady na nasazení pesticidů v důsledku nevyhnutelného vzniku rezistence a trvalého rizika šíření nemocí rezistentními přenašeči. Existují také značná rizika spojená s používáním syntetických genových pohonů. Jedním z rizik je přelévání genových pohonů do necílových populací a druhů. Navzdory nízké pravděpodobnosti přenosu genového disku mezi druhy Národní akademie věd Spojených států (USA) v současné době doporučuje, aby bylo riziko horizontálního přenosu genů vyhodnoceno před jakýmkoli zvažovaným uvolněním genového disku do životního prostředí . Kromě přímých rizik genových pohonů ovlivňujících necílové druhy je také důležité posoudit širší důsledky, které bude mít odstranění nebo změna cílové populace nebo druhu na širší ekosystém.

Diskuse kolem této technologie částečně pramení z nedostatečných znalostí o přírodních, natož syntetických genových pohonech. Zdá se, že panuje shoda v tom, že v současné době není možné vyhodnotit, zda přínosy převažují nad riziky, ale že by to nemělo znamenat, že by výzkum a pokusy využívající genový pohon měly být zakázány. Například doporučení Královské společnosti pro Úmluvu Organizace spojených národů (OSN) o biologické rozmanitosti (CBD) je vyhnout se přijetí jakéhokoli stanoviska, které by podpořilo mezinárodní moratorium na výzkum genových pohonů, včetně experimentálních polních pokusů, což je stanovisko, které zaznělo na zasedání CBD OSN v listopadu loňského roku . Moratorium bylo nakonec zamítnuto. Námitka vznikla částečně proto, že pokud by byl výzkum genových pohonů zakázán, vedlejší efekt by byl škodlivý, protože by v podstatě znemožnil jakoukoli širší veřejnou diskusi předtím, než bychom zjistili potenciální riziko, a tedy vyhodnotili, jak bychom mohli tuto technologii bezpečně používat.

Moratorium však bylo přeformulováno tak, aby zdůrazňovalo potřebu konzultovat s místními komunitami a domorodými skupinami, které jsou potenciálně ovlivněny, předtím, než se začne uvažovat o případném uvolnění, což je ozvěnou doporučení George a kol. a Ritchieho & Stantona v tomto čísle. Obecně platí, že jakémukoli potenciálnímu budoucímu použití genových pohonů by měla předcházet veřejná diskuse o relativní přitažlivosti použití genových pohonů ve srovnání s alternativními řešeními. Velký význam byl kladen na zajištění toho, aby byl budoucí výzkum vhodně řízen tak, aby zahrnoval různé širší společenské dopady, kromě zohlednění biologické bezpečnosti a nežádoucích ekologických a zdravotních dopadů . Takový konzultační přístup je zdůrazněn v příspěvku George et al. , kteří rovněž upozorňují na složitosti spojené s etickými úvahami o vypouštění upravených genových stimulátorů do přírody. Důležitost zajištění dostatečné důvěry veřejnosti a politiků zdůrazňuje také Ritchie & Staunton , který tvrdí, že je to klíčové pro zajištění širšího využití. Příkladem úspěchu tohoto přístupu je práce prováděná neziskovým výzkumným konsorciem Target Malaria (targetmalaria.org/who-we-are/), jehož cílem je vývoj a sdílení technologií pro kontrolu malárie. Konsorcium zahrnuje vědce, týmy pro zapojení zainteresovaných stran, odborníky na hodnocení rizik a regulační experty z Afriky, Severní Ameriky a Evropy a jeho součástí je i etický poradní výbor.

Kromě využití přirozeně se vyskytujících endosymbiontů, jako je Wolbachia, k narušení přenosu nemocí u komárů, nebyl dosud žádný syntetický genový pohon vypuštěn do volně žijící populace. Americké ministerstvo zemědělství vyloučilo rostliny s upraveným genomem z regulačního dohledu, takže se to může změnit. Australská vláda také nedávno rozhodla, že nebude regulovat používání technik genové editace, které nevnášejí do organismů nový genetický materiál, ale zvýší své požadavky na monitorování experimentů s genovými pohony . Naproti tomu Soudní dvůr Evropské unie rozhodl, že geneticky upravené plodiny by měly být považovány za geneticky modifikované organismy podléhající přísné regulaci . Je zřejmé, že neexistuje celosvětová shoda.

Používání „biologických“ kontrolních opatření, jako je endosymbiont Wolbachia, který po vnesení do komárů A. aegypti potlačuje přenos virů dengue, Zika a chikungunya, se již dočkalo rozsáhlých polních zkoušek v Austrálii i jinde . První úspěšné použití cytoplazmaticky indukované samčí sterility ke kontrole komárů rodu Culex bylo provedeno v Barmě před více než 50 lety , a v současné době probíhá několik velkých pilotních vypouštění komárů Aedes modifikovaných wMel (World Mosquito Program: http://www.eliminatedengue.com/our-research/wolbachia). Jejich úspěšné nasazení je závislé na silné společenské a politické podpoře (např. úspěšný Světový program proti komárům zaměřený na eliminaci horečky dengue), protože bez ní pravděpodobně selžou, jako v případě několika schválených pokusů, kterým chyběla podpora . Je pozoruhodné, že použití přirozeně se vyskytujících látek, jako je Wolbachia (která může způsobit účinnou sterilizaci vyvoláním cytoplazmatické inkompatibility), se zdá být ve srovnání se syntetickými genovými pohony méně zatíženo obavami o jejich bezpečnost. Komáři infikovaní Wolbachií však účinně zavádějí geny do populací, a proto je lze považovat za obdobu genových pohonů . Je možné, že čím více se naučíme využívat tyto přirozeně se vyskytující genové drivery, tím více se sníží naše současné obavy z používání syntetických driverů?

Závěrečné poznámky a budoucí směry

Z jednotlivých příspěvků v tomto čísle vyplývá řada obecných závěrů a slibných cest pro budoucí výzkum. Níže zdůrazňujeme některé z nejvýznamnějších bodů.

Je třeba zvážit nejen technické, ale také etické a společenské aspekty syntetického genového pohonu. Jak tvrdí Ritchie & Staunton a George et al. podpora komunit, kterých se uvolnění genového pohonu týká, je pro jejich úspěšnou realizaci rozhodující. Je naprosto nezbytné, aby při jakémkoli budoucím uvolnění bylo vynaloženo velké úsilí na vysvětlení všech relevantních aspektů projektu a získání podpory místních zainteresovaných stran. Rozruch kolem geneticky modifikovaných plodin ukazuje, jak špatně může dopadnout projekt, který se netěší důvěře veřejnosti. Jediný způsob, jak mohou být tyto potenciálně život zachraňující technologie genového pohonu prakticky užitečné, je dobrý začátek a úspěšné projekty, které získají významnou podporu místních obyvatel. Při arogantním přístupu shora dolů hrozí, že se technologie genového pohonu stanou politicky toxickými a budou po desetiletí nepoužitelné. To by mohlo mít tragické následky pro lidské zdraví, zemědělství a ochranu přírody. Existují však úspěšné příklady , takže tento konzultační přístup může fungovat. Je možné, že z úspěšného využití využití přírodních systémů, jako je Wolbachia, ke snížení přenosu nemocí u komárů, lze vyvodit široké poučení, které lze implementovat i pro nasazení syntetického pohonu?

Klíčem k předvídání dynamiky genového pohonu je pochopení nákladů. Byly učiněny velké pokroky v kvantifikaci potenciálních nákladů genového pohonu v přírodních systémech, jak je uvedeno v tomto zvláštním článku. Náklady na fitness však mohou být obtížně zjistitelné: například zjištění Finnegana a kol. o snížené životaschopnosti spojené s meiotickým pohonem u mouchy stonohé přišlo až po několika předchozích studiích nákladů na fitness u stejného druhu. Zejména je třeba lépe zdokumentovat potenciální náklady pohonu v méně dobře charakterizovaném přirozeném systému pohonu zahrnujícím nemodelové druhy (tj. jiné než mouchy a myši domácí). Nevíme také, zda se tyto náklady v průběhu času mění, jak by předpokládala koevoluční reakce. Například náklady samiček mušek Drosophila simulans na přechovávání kmene Wolbachia Riverside se po pouhých 20 letech koevoluce změnily z počátečních 15-20 % nákladů na plodnost na 10 % výhodu plodnosti . Kvantifikace fitness nákladů pohonu u samců i samic je zásadní pro přesnou předpověď dynamiky pohonu v přírodních populacích (např. ). Subtilní náklady pudu mohou také ovlivnit úspěšnost syntetických pudů. Beaghton et al. také zkoumají transgenerační dopad empiricky prokázaných fitness nákladů, což byl překvapivý objev ve výzkumu syntetických genových pohonů. Je zřejmé, že existuje prostor jak pro lepší zpřesnění stávajících predikčních modelů, tak pro shromáždění více údajů o potenciálních fitness nákladech v systémech syntetických pohonů, aby se zlepšila naše předpověď dynamiky syntetických pohonů v přírodních populacích.

Relativní význam vyvážení nákladů versus potlačení pro úspěch genových pohonů. Klíčem k úspěchu zavádění syntetických genových pohonů pro kontrolu populací je jejich přetrvávání po dostatečně dlouhou dobu, aby se dosáhlo redukce (nebo eliminace) cílové populace. Proto je zásadním cílem oddálení pravděpodobnosti a rychlosti vývoje potlačení. Zdá se však, že perzistence mnoha přirozených systémů genového pohonu závisí spíše na síle vyrovnávací selekce než na evoluci suprese. V současné době nevíme, jaké vlastnosti systému genového pohonu způsobují, že je více či méně pravděpodobné, že bude utvářen vyrovnávací selekcí na rozdíl od suprese. Nevíme také, zda existují nějaké podobnosti mezi starými genovými pohony, u nichž nebyly nalezeny supresory (např. pohon poměru pohlaví u D. pseudoobscura, t haplotyp u myší domácích a dlouhodobé přetrvávání zabíjení samců vyvolané Wolbachií u Drosophila innubila ). Částečně tento nedostatek poznatků vyplývá z omezených znalostí o genu (genech) podílejících se na pohonu, protože mechanismy nejsou u mnoha systémů známy . Nicméně stejně jako v případě pohlavního pudu (např. D. simulans, ) existují příklady systémů zabíjení samců, které vykazují dramatický tok invaze, potlačení, nahrazení a obnovení zabíjení napříč populacemi (např. motýli Hypolimnas bolina ). Srovnání těchto přirozených systémů pohonu může odhalit potenciální vlastnosti, které jsou spojeny s dlouhodobým přetrváváním nepotlačených systémů pohonu a které by snad mohly být zahrnuty do návrhu syntetických pohonů. Existují například potenciální nákladné pleiotropní důsledky potlačení, které jsou prostě příliš velké na to, aby byly překonány? Na druhou stranu je možné, že dlouhodobé přetrvávání nepotlačených systémů je vlastností komplexního systému pohonu zahrnujícího více genů, a proto je nepravděpodobné, že by se v praxi promítl do syntetických ovladačů, protože jsou jednoduše příliš složité na konstrukci. Dosud ani nevíme, zda je přetrvávající genový pohon spojen s několika málo nebo mnoha koevolučními geny. Je zřejmé, že potřebujeme lépe pochopit mechanismy pohonu a potlačování přirozených systémů, než se tyto poznatky promítnou do konstrukce syntetických ovladačů.

Kromě toho existuje několik neprozkoumaných možností genových pohonů.

(i)

Mnoho navrhovaných využití genových pohonů zahrnuje snížení škodlivosti přenašečů nemocí pro člověka, humánní odstraňování zavlečených zvířat ve prospěch ochrany přírody nebo boj proti škůdcům plodin či plevelům , což by mohlo snížit úmrtnost na nemoci a omezit používání pesticidů a jedů. Existují však i další potenciální využití , například zavádění prospěšných alel do populací za účelem rychlého šíření adaptivní variability. Řízení adaptivní variability by mohlo urychlit adaptaci na hrozby potenciálně způsobující vymírání, jako je změna klimatu, nebo ochranu obojživelníků před houbou chytrid, která se již podílí na vymírání 90 druhů .

(ii)

Hlavní obavy z používání genových pohonů spočívají v tom, že se vymknou kontrole, dostanou se do necílových populací, budou přeskakovat mezi druhy a budou mít nezamýšlené negativní důsledky. Je však možné, že nejbezpečnějším a nejúčinnějším využitím genových pohonů bude naopak jejich použití v koordinaci se stávajícími kontrolními technikami . Například pro cílený zásah proti plevelům může být v zemědělské oblasti uvolněn genový disk, který nese náchylnost k herbicidu. Tento pohon s sebou nese malé okamžité náklady, takže se může rychle rozšířit. Náklady na fitness se projeví až při skutečném nasazení herbicidů na polích a řízené použití omezuje tyto náklady na cílové oblasti. I když se genový pohon rozšíří do volně žijících populací daného druhu plevele nebo příbuzných druhů, které nejsou škůdci, náklady na dobře navrženou náchylnost k herbicidům budou pravděpodobně nízké s výjimkou míst, kde jsou herbicidy nasazeny. Jedním z problémů genových pohonů navržených k rychlému šíření a vyhubení cílového organismu je zpeněžení, protože pohon, který rychle vyhubí cílový druh, nemá dlouhodobý zdroj příjmů. Genové pohony vyvinuté jako součást komplexního plánu boje proti škůdcům, kde je poškození pohonem závislé na nasazení druhého faktoru, by mohly být bezpečné a kontrolovatelné, dlouhodobě finančně úspěšné a pro veřejnost přijatelnější.

(iii)

Přirozené genové pohony, které byly objeveny, a syntetické ovladače, které byly zkonstruovány, působí relativně přímo. Šíří se přeměnou genů, zabíjejí gamety, které pohon nenesou, skartují konkurenční chromozomy a používají další spíše brutální přístupy. Je však pravděpodobné, že existuje mnoho rafinovanějších možností genového pohonu. Ve skutečnosti mnohé z nich možná již v přírodě existují, ale dosud nebyly objeveny, protože je vědci nehledají nebo neinterpretují jako pohon. Fascinující příklad se vyskytuje u mravenců ohnivých (Solenopsis invicta). Genový pohon, lokus Gp-9, v rámci velké inverze, má behaviorální účinky na dělnice nesoucí pohon, které vedou k výhodě přenosu pro tento lokus – selektivní eliminaci královen, které nejsou jeho nositelkami, a toleranci více královen-nositelek v kolonii . Má to ekologické důsledky, protože mravenci ohniváci jsou v Severní Americe invazní a úspěch invaze je spojen se zvýšeným počtem královen . Je pravděpodobné, že existují další nereprodukční genové pohony, možná poháněné tendencemi rodičovské péče nebo siblicidou, které ještě nebyly objeveny nebo o kterých se teprve uvažuje.

Souhrnně příspěvky tohoto zvláštního čísla ukazují obrovský potenciál systémů genových pohonů, ale také upozorňují na několik nevyřešených mezer ve znalostech. Zejména širší etické a společenské důsledky využití a uvolnění síly sobeckých genů v přírodních populacích jsou stále teprve na počátku řešení.

Dostupnost dat

Tento článek neobsahuje žádná další data.

Konkurenční zájmy

Prohlašujeme, že nemáme žádné konkurenční zájmy.

Financování

Na tuto studii jsme neobdrželi žádné finanční prostředky.

Poděkování

Autoři jsou velmi vděční za možnost editovat toto speciální číslo o genovém pohonu a rádi by poděkovali všem autorům, kteří se na tomto čísle podíleli.

Poznámky

Jeden příspěvek do speciálního čísla „Přírodní a syntetické systémy genového pohonu“. Guest edited by Nina Wedell, Anna Lindholm and Tom Price.

© 2019 The Author(s)

Published by the Royal Society. Všechna práva vyhrazena.

  • Burt A, Trivers R. 2006Geny v konfliktu: biologie sobeckých genetických prvků. Cambridge, MA: Harvard University Press. Crossref, Google Scholar
  • Hammerberg C, Klein JAN. 1975Evidence for postmeiotic effect of t factors causing segregation distortion in mouse (Důkaz postmeiotického účinku t faktorů způsobujících segregační distorzi u myší). Nature 253, 137-138. (doi:10.1038/253137a0) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Jaenike J. 2001Sex chromosome meiotic drive. Annu. Rev. Ecol. Syst. 32, 25-49. (doi:10.1146/annurev.ecolsys.32.081501.113958) Crossref, Google Scholar
  • Burt A. 2003Samostatné sobecké geny jako nástroje pro kontrolu a genetické inženýrství přírodních populací. Proc. R. Soc. Lond. B 270, 20022319. (doi:10.1098/rspb.2002.2319) Link, ISI, Google Scholar
  • Kyrou K, Hammond AM, Galizi R, Kranjc N, Burt A, Beaghton AK, Nolan T, Crisanti A. 2018A CRISPR-Cas9 gene drive targeting doublesex causes complete population suppression in caged Anopheles gambiae mosquitoes. Nat. Biotechnol. 36, 1062. (doi:10.1038/nbt.4245) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Galizi R, Doyle LA, Menichelli M, Bernardini F, Deredec A, Burt A, Stoddard BL, Windbichler N, Crisanti A. 2014A synthetic sex ratio distortion system for the control of the human malaria mosquito. Nat. Commun. 5, 3977. (doi:10.1038/ncomms4977) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Gantz VM, Jasinskiene N, Tatarenkova O, Fazekas A, Macias VM, Bier E, James AA. 2015Vysoce účinný genový pohon zprostředkovaný Cas9 pro modifikaci populace komára Anopheles stephensi, přenašeče malárie. Proc. Natl Acad. Sci. USA 112, E6736-E6743. (doi:10.1073/pnas.1521077112) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • National Academies of Sciences Engineering, and Medicine. 2016Gene drives on the horizon: advancing science, navigating uncertainty, and aligning research with public values, 230 s. Washington, DC: The National Academies Press. Google Scholar
  • Bastide H, Cazemajor M, Ogereau D, Derome N, Hospital F, Montchamp-Moreau C. 2011Rapid rise and fall of selfish sex-ratio X chromosomes in Drosophila simulans: spatiotemporal analysis of phenotypic and molecular data. Mol. Biol. Evol. 28, 2461-2470. (doi:10.1093/molbev/msr074) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Ritchie SA, Staunton KM. 2019Reflections from an old Queenslander: Can back and release strategies be the next great era of vector control?“ (Úvahy starého Queenslanďana: mohou být strategie chovu a vypouštění další velkou érou kontroly vektorů?) Proc. R. Soc. B 286, 20190973. (doi:10.1098/rspb.2019.0973) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Barrett LG, Legros M, Kumaran N, Glassop D, Raghu S, Gardiner DM. 2019Gene drives in plants: opportunities and challenges for weed control and engineered resilience (Genové pohony v rostlinách: příležitosti a výzvy pro kontrolu plevelů a inženýrskou odolnost). Proc. R. Soc. B 286, 20191515. (doi:10.1098/rspb.2019.1515) Link, ISI, Google Scholar
  • Beaghton AK, Hammond A, Nolan T, Crisanti A, Burt A. 2019Gene drive for population genetic control: non-functional resistance and parental effects. Proc. R. Soc. B 286, 20191586. (doi:10.1098/rspb.2019.1586) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Oberhofer G, Ivy T, Hay BA. 2018Behavior of homing endonuclease gene drives targeting genes required for viability or female fertility with multiplexed guide RNAs (Chování naváděcích endonukleázových genových pohonů zaměřených na geny potřebné pro životaschopnost nebo plodnost samic pomocí multiplexovaných vodicích RNA). Proc. Natl Acad. Sci. USA 115, E9343-E9352. (doi:10.1073/pnas.1805278115) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Holman L. 2019Evolutionary simulations of Z-linked suppression gene drives. Proc. R. Soc. B 286, 20191070. (doi:10.1098/rspb.2019.1070) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Godwin Jet al.. 2019Rodentní genové pohony pro ochranu přírody: příležitosti a potřeby dat. Proc. R. Soc. B 286, 20191606. (doi:10.1098/rspb.2019.1606) Link, ISI, Google Scholar
  • Grunwald HA, Gantz VM, Poplawski G, Xu X-RS, Bier E, Cooper KL. 2019Supermendelovská dědičnost zprostředkovaná CRISPR-Cas9 v samičí zárodečné linii myší. Nature 566, 105-109. (doi:10.1038/s41586-019-0875-2) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Manser A, Cornell SJ, Sutter A, Blondel DV, Serr M, Godwin J, Price TAR. 2019Kontrola invazních hlodavců prostřednictvím syntetického genového pohonu a úloha polyandrie. Proc. R. Soc. B 286, 20190852. (doi:10.1098/rspb.2019.0852) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Backus G, Gross K. 2016Genetic engineering to eradicate invasive mice on islands: modeling the efficiency and ecological impacts. Ecosphere 7, e01589. (doi:10.1002/ecs2.1589) Crossref, ISI, Google Scholar
  • Leitschuh CM, Kanavy D, Backus GA, Valdez RX, Serr M, Pitts EA, Threadgill D, Godwin J. 2018Developing gene drive technologies to eradicate invasive rodents from islands. J. Responsible Innov. 5, S121-S138. (doi:10.1080/23299460.2017.1365232) Crossref, ISI, Google Scholar
  • Taylor ML, Price TAR, Wedell N. 2014Polyandrie v přírodě: globální analýza. Trends Ecol. Evol. 29, 376-383. (doi:10.1016/j.tree.2014.04.005) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • George DR, Kuiken T, Delborne JA. 2019Artikulování svobodného, předchozího a informovaného souhlasu (FPIC) pro inženýrské genové pohony. Proc. R. Soc. B 286, 20191484. (doi:10.1098/rspb.2019.1484) Link, ISI, Google Scholar
  • Finnegan SR, White NJ, Koh D, Camus MF, Fowler K, Pomiankowski A. 2019Meiotic drive reduces egg-to-adult viability in stalk-eyed flies. Proc. R. Soc. B 286, 20191414. (doi:10.1098/rspb.2019.1414) Link, ISI, Google Scholar
  • Larner W, Price T, Holman L, Wedell N. 2019An X-linked meiotic drive allele has strong, recessive fitness costs in female Drosophila pseudoobscura. Proc. R. Soc. B 286, 20192038. (doi:10.1098/rspb.2019.2038) Link, ISI, Google Scholar
  • Dyer K, Hall D. 2019Fitness consequences of a non-recombining sex-ratio drive chromosome can explain its prevalence in wild. Proc. R. Soc. B 286, 20192529. (doi:10.1098/rspb.2019.2529) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Lea JK, Unckless RL. 2019An assessment of the immune costs associated with meiotic drive elements in Drosophila [Posouzení imunitních nákladů spojených s meiotickými hnacími elementy u drozofily]. Proc. R. Soc. B 286, 20191534. (doi:10.1098/rspb.2019.1534) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Courret C, Chang C-H, Wei KH-C, Montchamp-Moreau C, Larracuente AM. 2019Meiotic drive mechanisms: lessons from Drosophila (Mechanismy meiotického pohonu: poučení z drozofily). Proc. R. Soc. B 286, 20191430. (doi:10.1098/rspb.2019.1430) Link, ISI, Google Scholar
  • Price T, Verspoor R, Wedell N. 2019Ancient gene drives: an evolutionary paradox. Proc. R. Soc. B 286, 20192267. (doi:10.1098/rspb.2019.2267) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Babcock CS, Anderson WW. 1996Molekulární evoluce komplexu inverze pohlaví u Drosophila pseudoobscura: analýza oblasti genu Esterase-5. Mol. Biol. Evol. 13, 297-308. (doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025589) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Windbichler Net al.. 2011Syntetický systém genového pohonu založený na naváděcí endonukleáze u lidského komára malarického. Nature 473, 212-215. (doi:10.1038/nature09937) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Buchman A, Marshall JM, Ostrovski D, Yang T, Akbari OS. 2018Synteticky upravený systém genového pohonu Medea u celosvětově rozšířeného škůdce plodin Drosophila suzukii. Proc. Natl Acad. Sci. USA 115, 4725-4730. (doi:10.1073/pnas.1713139115) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Beeman R, Friesen K, Denell R. 1992Maternal-effect selfish genes in flour beetles. Science 256, 89-92. (doi:10.1126/science.1566060) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Wood RJ, Newton ME. 1991Sex-ratio distortion caused by meiotic drive in mosquitoes [Narušení poměru pohlaví způsobené meiotickým pohonem u komárů]. Am. Nat. 137, 379-391. (doi:10.1086/285171) Crossref, ISI, Google Scholar
  • Herrmann BG, Bauer H. 2012The mouse t-haplotype: a selfish chromosome-genetics, molecular mechanism, and evolution. In Evolution of the house mouse (eds Macholán M, Baird SJE, Munclinger P, Piálek J), 23. dubna 2019. Cambridge: Cambridge University Press. Google Scholar
  • Lindholm A, Sutter A, Künzel S, Tautz D, Rehrauer H. 2019Effects of a male meiotic driver on male and female transcriptomes in the house mouse. Proc. R. Soc. B 286, 20191927. (doi:10.1098/rspb.2019.1927) Odkaz, ISI, Google Scholar
  • Esvelt KM, Smidler AL, Catteruccia F, Church GM. 2014Concerning RNA-guided gene drives for the alteration of wild populations. eLife 3, e03401. (doi:10.7554/eLife.03401) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Sheppard Aet al.2017Syntetické genové pohony v Austrálii: důsledky nových technologií. Canberra, Austrálie: Australská akademie věd. Google Scholar
  • Gerber R, Smit NJ, Van Vuren JHJ, Nakayama SMM, Yohannes YB, Ikenaka Y, Ishizuka M, Wepener V. 2016Bioaccumulation and human health risk assessment of DDT and other organochlorine pesticides in an apex aquatic predator from a premier conservation area. Sci. Total Environ. 550, 522-533. (doi:10.1016/j.scitotenv.2016.01.129) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Lohr MT, Davis RA. 2018Používání antikoagulačních rodenticidů, necílové dopady a regulace: případová studie z Austrálie. Sci. Total Environ. 634, 1372-1384. (doi:10.1016/j.scitotenv.2018.04.069) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Královská společnost. 2018Výzkum pohonu genů: proč na něm záleží, 1-33 s. Viz https://royalsociety.org/-/media/policy/Publications/2018/08-11-18-gene-drive-statement.pdf. Google Scholar
  • Callaway E. 2018Zákaz „genových pohonů“ je opět na programu OSN – znepokojuje vědce. Nature 563, 454-455. (doi:10.1038/d41586-018-07436-4) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Mallapaty S. 2019Australian gene-editing rules adopt ‚middle ground‘. Nature. (doi:10.1038/d41586-019-01282-8) Crossref, Google Scholar
  • Ledford H. 2019CRISPR conundrum: strict European court ruling leaves food-testing labs without a plan. Nature 572, 15. (doi:10.1038/d41586-019-02162-x) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Anders KLet al.2018The AWED trial (Applying Wolbachia to Eliminate Dengue) to assess the efficacy of Wolbachia-infected mosquito deployments to reduce dengue incidence in Yogyakarta, Indonesia: study protocol for a cluster randomized controlled trial. Trials 19, 302. (doi:10.1186/s13063-018-2670-z) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Laven H. 1967Eradikace Culex pipiens fatigans prostřednictvím cytoplazmatické inkompatibility. Nature 216, 383-384. (doi:10.1038/216383a0) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Macias VM, Ohm JR, Rasgon JL. 2017Gene drive for mosquito control: Where did it come from and where are we headed (Genový pohon pro kontrolu komárů: odkud se vzal a kam směřujeme?) Int. J. Environ. Res. Public Health 14, 1006. (doi:10.3390/ijerph14091006) Crossref, ISI, Google Scholar
  • Weeks AR, Turelli M, Harcombe WR, Reynolds KT, Hoffmann AA. 2007Od parazita k mutualistovi: rychlá evoluce wolbachie v přírodních populacích drozofily. PLoS Biol. 5, e114. (doi:10.1371/journal.pbio.0050114) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Jaenike J, Dyer KA. 2008Žádná rezistence vůči samce zabíjejícím wolbachiím po tisícileté infekci. J. Evol. Biol. 21, 1570-1577. (doi:10.1111/j.1420-9101.2008.01607.x) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Bastide H, Gérard PR, Ogereau D, Cazemajor M, Montchamp-Moreau C. 2013Local dynamics of a fast-evolving sex-ratio system in Drosophila simulans. Mol. Ecol. 22, 5352-5367. (doi:10.1111/mec.12492) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Charlat S, Hornett EA, Fullard JH, Davies N, Roderick GK, Wedell N, Hurst GDD. 2007Mimořádná fluktuace v poměru pohlaví. Science 317, 214. (doi:10.1126/science.1143369) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Dearden PKet al.2018The potential for the use of gene drives for pest control in New Zealand: a perspective. J. R. Soc. New Zeal. 48, 225-244. (doi:10.1080/03036758.2017.1385030) Crossref, ISI, Google Scholar
  • Scheele BCet al.. 2019Panzootické houby obojživelníků způsobují katastrofální a pokračující ztrátu biodiverzity. Science 363, 1459-1463. (doi:10.1126/science.aav0379) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Keller L, Ross KG. 1998Selfish genes: a green beard in the red fire ant (Sebevražedné geny: zelené vousy u mravence ohnivého). Nature 394, 573-575. (doi:10.1038/29064) Crossref, ISI, Google Scholar
  • Wang J, Wurm Y, Nipitwattanaphon M, Riba-Grognuz O, Huang Y-C, Shoemaker D, Keller L. 2013A Y-like social chromosome causes alternative colony organization in fire ants. Nature 493, 664-668. (doi:10.1038/nature11832) Crossref, PubMed, ISI, Google Scholar
  • Tsutsui ND, Suarez AV. 2003The colony structure and population biology of invasive ants [Struktura kolonií a populační biologie invazních mravenců]. Conserv. Biol. 17, 48-58. (doi:10.1046/j.1523-1739.2003.02018.x) Crossref, ISI, Google Scholar

.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.