De klinische geneeskunde wordt voornamelijk bediend door de Bodleian Health Care Libraries op vier locaties die collecties van actueel materiaal huisvesten. De Bodleian Health Care Libraries bedienen zowel de universiteit als het lokale NHS personeel. De specialisaties zijn als volgt:

Cairns Library, John Radcliffe Hospital: Acute algemene geneeskunde/chirurgie (alle disciplines), Verloskunde en gynaecologie, Kindergeneeskunde, Geratologie, AIDS, Neurowetenschappen, Otorhinolaryngologie, Oogheelkunde en cursusboeken.

Kenniscentrum, Onderzoeksgebouw Old Road Campus: Epidemiologie, Evidence Based Healthcare, Gezondheidsbeleid, Volksgezondheidsgeneeskunde, Statistiek, Diabetes, Oncologie, Radiotherapie.

NOC Bibliotheek, Nuffield Orthopaedic Centre: Orthopedie, Musculoskeletale Wetenschappen, Reumatologie, Neurologische Ziekten en Neurorevalidatie, Orthotica, Prothesen, Fysiotherapie, Ergotherapie, Gezondheidsmanagement, en Verpleging.

Horton Library, Horton General Hospital: Algemene geneeskunde, verloskunde en gynaecologie, verpleging en vroedkunde, neonatologie, gastro-enterologie en hepatologie, kindergeneeskunde, gerontologie, cardiologie, ademhalingsgeneeskunde, traumatologie en orthopedie, endocrinologie, psychiatrie en geestelijke gezondheid, psychologie, spoedeisende geneeskunde, intensive care, chirurgie en anesthesie, pathologie, microbiologie en gezondheidsmanagement.

Niet-klinische geneeskunde wordt voornamelijk bediend door de Radcliffe Science Library. De uitgebreide collecties van deze bibliotheek op het gebied van biowetenschappen en geneeskunde dateren uit de 19e eeuw en omvatten wettelijk gedeponeerd en aangekocht materiaal van zowel historisch als hedendaags belang. De bibliotheek verzamelt wettelijk gedeponeerd materiaal in de klinische geneeskunde, en wettelijk gedeponeerd en aangekocht materiaal in niet-klinische onderwerpen zoals experimentele psychologie, menselijke anatomie en genetica, fysiologie, pathologie en farmacologie.