In de bio-informatica is miRBase een biologische databank die fungeert als een archief van microRNA-sequenties en -annotaties. In september 2010 bevatte de databank informatie over 15 172 microRNA’s. In maart 2018 was dit aantal gestegen tot 38.589. Het miRBase-register biedt een gecentraliseerd systeem voor het toekennen van nieuwe namen aan microRNA-genen.
microRNA database
Universiteit van Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase is gegroeid uit de microRNA-registerbron die in 2003 door Sam Griffiths-Jones is opgezet.
Volgens Ana Kozomara en Sam Griffiths-Jones heeft miRBase vijf doelstellingen:
- Een consistent naamgevingssysteem voor microRNAs
- Een centrale plaats voor het verzamelen van alle bekende microRNA-sequenties
- Menselijke en computerleesbare informatie verschaffen voor elk microRNA
- Om primair bewijs voor elke microRNA te leveren
- Om informatie over en links naar microRNA-doelwitten te verzamelen
MiRBase bevat miRNAs van verschillende soorten die behoren tot Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae en Virussen. Voor de Viridiplantae zijn in release 21 (2014) gegevens beschikbaar voor 73 soorten. Dit omvat 4800 unieke mature miRNA’s en 8480 precursor sequenties.
De huidige versie van MiRBase is release 22 (maart 2018).