Milton Obote, voluit Apollo Milton Obote, (geboren 28 december 1924, Akoroko, Lango, Oeganda – overleden 10 oktober 2005, Johannesburg, Zuid-Afrika), politicus die premier (1962-70) en tweemaal president (1966-71, 1980-85) van Oeganda was. Hij leidde zijn land naar de onafhankelijkheid in 1962, maar zijn twee ambtstermijnen (die beide werden beëindigd door militaire coups) werden in beslag genomen door gevechten tussen de noordelijke en zuidelijke etnische groepen van Oeganda.
Obote werd geboren als derde van negen kinderen in een boerengezin in noord-centraal Oeganda. Hij bezocht eerst het Busoga College in Mwiri en vervolgens het Makerere College in Kampala van 1948 tot 1949, maar hij werd van het laatste college gestuurd vanwege zijn politieke activiteiten voordat hij kon afstuderen. De Britse koloniale regering belette hem beurzen aan te nemen om in de Verenigde Staten en West-Duitsland te studeren, en in 1950 ging Obote naar Kenia. Daar raakte hij, terwijl hij werkte als arbeider, klerk en verkoper, betrokken bij de onafhankelijkheidsbeweging en sloot zich aan bij de Kenya African Union.
Obote keerde in 1957 terug naar Oeganda en werd lid van de Uganda National Congress Party. In 1958 werd hij gekozen om zijn thuisdistrict te vertegenwoordigen in de Wetgevende Raad, waar hij, ondanks het feit dat hij een van de weinige Afrikaanse afgevaardigden was, niet aarzelde om de Britse regering te bekritiseren. Toen de National Congress Party uiteenviel, vormde hij het Uganda People’s Congress (UPC), dat vooral steun kreeg van de noordelijke Acholi- en Lango-volkeren. De UPC richtte zich vooral op het verzet tegen het machtige zuidelijke koninkrijk Buganda onder koning Mutesa II. Nadat hij in 1962 premier was geworden, aanvaardde Obote een grondwet die vijf traditionele koninkrijken, waaronder Buganda, een federale status binnen Oeganda verleende. Zo kon hij een regeringscoalitie vormen die bestond uit zijn UPC en Buganda’s Kabaka Yekka (“King Alone”) Partij. In 1963 werd Mutesa, met Obote’s aanmoediging, gekozen tot de (grotendeels ceremoniële) post van president.
In 1966 bereikte het conflict tussen Obote en Buganda echter een hoogtepunt. Obote stuurde troepen onder leiding van Idi Amin, een officier uit een noordelijk district, om het paleis van Mutesa aan te vallen, en Mutesa vluchtte naar Groot-Brittannië. In een poging om zijn heerschappij te verstevigen, voerde Obote een nieuwe grondwet in die alle koninkrijken en andere overblijfselen van federalisme in het land afschafte. De nieuwe grondwet stelde ook een uitvoerend presidentschap in, dat Obote op zich nam terwijl hij minister-president bleef. Maar Obote’s toenemende gebruik van het leger en de politie om zijn politieke tegenstanders te terroriseren wekte de wrevel van de zuidelijke Oegandezen, en het stelde Amin in staat een aanhang op te bouwen, gebaseerd op rekruten uit zijn eigen Kakwa-volk. Begin 1971 werd Obote omvergeworpen door een staatsgreep onder leiding van Amin.
Obote vestigde zich in het naburige Tanzania, waar hij een klein emigrantenleger onderhield onder leiding van Tito Okello, een Acholi. Dit leger hielp de Tanzaniaanse troepen bij de afzetting van Amin in 1979, en Okello wist Obote na zijn terugkeer uit ballingschap in mei 1980 tot president te laten kiezen. Als president vroeg Obote om buitenlandse hulp in een poging de economie van Oeganda uit het dal van de Amin-jaren te halen, maar hij deed niets om te voorkomen dat Acholi- en Lango-soldaten een moord- en plundercampagne voerden in het zuiden en in het thuisdistrict van Amin. In 1985 werd Obote door Okello uit zijn ambt gezet. Hij vestigde zich uiteindelijk in Zambia maar bleef een actieve rol spelen in de UPC tot aan zijn dood in 2005.