Om de genen en genfuncties te identificeren die ten grondslag liggen aan belangrijke aspecten van de biologie van peulvruchten, hebben onderzoekers het koele seizoen peulgewas Medicago truncatula geselecteerd als een modelsysteem voor peulvruchtenonderzoek. De missie van het M. truncatula Consortium is het bevorderen van het onbeperkt delen van gegevens en informatie die door Medicago onderzoeksgroepen wereldwijd worden verstrekt. Door de integratie van een verscheidenheid aan gegevens en instrumenten beoogt de medicago.org site de vooruitgang op het gebied van structurele, vergelijkende en functionele genomica te vergemakkelijken. Om dit doel te bereiken heeft het Center for Computational Genomics and Bioinformatics (CCGB) van de Universiteit van Minnesota als consortiumpartner MtDB2.0 ontwikkeld, de M. truncatula databank versie 2.0. De MtDB2.0 database is de eerste stap in de richting van de wereldwijde integratie van M. truncatula genomische, genetische en biologische informatie. MtDB2.0 is een relationele database die M. truncatula transcriptoomgegevens integreert en een brede waaier aan door de gebruiker gedefinieerde dataminingopties biedt. De database wordt geraadpleegd via een reeks interfaces, met 58 opties gegroepeerd in twee filters. Sequence identifiers van alle publieke M. truncatula sites zijn volledig cross-referenced om vergelijkingen tussen verschillende sites te vergemakkelijken, en hypertext links naar de juiste database records zijn voorzien voor alle query’s resultaten. Het doel van de MtDB is om onderzoekers de middelen te bieden om snel en onafhankelijk sequenties te identificeren die overeenkomen met specifieke onderzoeksinteresses op basis van door de gebruiker gedefinieerde criteria. MtDB2.0 biedt onbeperkte toegang tot geavanceerde en krachtige query-tools die door geen enkele andere openbare databank worden geëvenaard. Structurad Query Language (SQL)-gecodeerde query’s met een op Java gebaseerde webgebruikersinterface bevatten verschillende filters die geavanceerde datamining mogelijk maken van de resultaten van express sequence tag-sequencingprojecten, waaronder de CCGB M. truncatula Unigene-reeks die is gegenereerd met de Phrap-assembler. De onderliggende database en query-software zijn zo ontworpen dat ze gemakkelijk kunnen worden bijgewerkt en naar andere modelorganismen kunnen worden overgedragen. Publieke toegang tot de database is te vinden op http://www.medicago.org/MtDB.