Johnny Sauter begon in 1996 met racen, nadat hij een belofte aan zijn vader, shorttrackracer Jim Sauter, was nagekomen: hij zou eerst zijn middelbare school afmaken voordat hij aan zijn carrière zou beginnen. In 1998 sloot hij zich aan bij de American Speed Association (ASA). In 2001 werd Sauter onder leiding van crewchief Joe Shear, Jr. uitgeroepen tot ASA-kampioen en Rookie of the Year met een recordaantal van 10 overwinningen.

Datzelfde jaar maakte hij zijn eerste start in wat nu bekend staat als de NASCAR Xfinity Series. Hij deelde de rit voor het seizoen 2003 en won het Xfinity Owners Championship. Sauter maakte dat jaar ook zijn NASCAR Cup Series-debuut en zijn NASCAR Camping World Truck Series-debuut.

Sauter stapte in 2009 fulltime over naar de Trucks en behaalde dat jaar zijn eerste overwinning op Las Vegas Motor Speedway. In 2016 claimde Sauter zijn eerste kampioenschap in de serie na een seizoen met drie overwinningen, één pole, 12 top-vijf finishes en een carrière-high 19 top-tien finishes.

Sauter bleef zijn plaats in de recordboeken in 2017 en 2018 verdienen, won 10 extra races en verzekerde zich van kampioenschap vier ligplaatsen in beide seizoenen; en werd de enige coureur in de serie die in alle drie de kampioenschapsgevechten verscheen sinds het begin van het Chase-formaat

Net als een echte echte racer, blijft Sauter op lokaal niveau concurreren in zijn thuisstaat Wisconsin, waar hij woont met zijn vrouw Cortney en hun vier kinderen.