MODELLER は、タンパク質の立体構造のホモロジーあるいは比較モデリングに使用されます(1,2)。 MODELLERは、空間的な制約を満たすことでタンパク質構造の比較モデリングを行うことができ(3,4)、さらに、タンパク質構造中のループのde novoモデリング、柔軟に定義した目的関数に対する様々なタンパク質構造モデルの最適化、タンパク質配列や構造の多重アライメント、クラスタリング、配列データベース検索、タンパク質構造の比較など多くのタスクを実行することができる。 MODELLERは、ほとんどのUnix/Linuxシステム、Windows、Macでダウンロード可能です。

MODELLERのいくつかのグラフィカルインターフェースが市販されています。 また、グラフィカルまたはウェブインターフェースや他のフレームワークでMODELLERを使用しているリソースや人々も多くいます。 Webb, A. Sali. 比較蛋白質構造モデリング モデラーを使用する。 Current Protocols in Bioinformatics 54, John Wiley& Sons, Inc., 5.6.1-5.6.37, 2016.

モデラーの現在のリリースは10.1であり、2021年3月18日にリリースされました。 モデラーは現在、Ben Webbによってメンテナンスされている

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