バイオインフォマティクスにおいて、microRNAの配列とアノテーションのアーカイブとして機能する生物学的データベースです。 2010年9月現在、15,172のmicroRNAの情報が含まれている。 この数は、2018年3月までに38,589個に増加している。 miRBaseレジストリは、microRNA遺伝子に新しい名前を割り当てるための集中システムを提供します。

miRBase

MiRBase logo.png

Content

Description

microRNA database

Contact

Research center

マンチェスター大学

著者名

アナ・コゾマラ

一次引用

コゾマラ&al. (2011)

公開日

アクセス

ウェブサイト

www.mirbase.org

miRBase は Sam Griffiths-Jones が 2003 年に設立した microRNA 登録リソースから発展しました。

Ana Kozomara 氏と Sam Griffiths-Jones 氏によると、miRBase には 5 つの目的があるそうです。

  1. マイクロRNAに一貫したネーミングシステムを提供すること
  2. すべての既知のマイクロRNA配列を集めた中心的な場所を提供すること
  3. それぞれのマイクロRNAについて人間およびコンピューターが読み取れる情報を提供すること
    1. 各microRNAの一次エビデンスの提供
    2. microRNAターゲット情報の集約とリンク

    MiRBase にはAlveolataに属する様々な種に属する miRNAが収録されています。 染色体動物、メタゾア、菌界動物、Viridiplantae、Virus。 Viridiplantaeについては、リリース21(2014)では73種のデータが利用可能です。 これには、4800のユニークな成熟miRNAと8480の前駆体配列が含まれています。

    MiRBaseの現在のバージョンは、リリース22(2018年3月)です。

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