| 入学編 | 1巻〜2巻 | ||
|---|---|---|---|
| 九校対抗編 | 3巻〜4巻。 第4巻 | ||
| 夏休み編 | 夏休み 優等生の補習 不思議の国のアメリア 友情の話。 信頼 と怪しげなロリコン 夏の思い出 大統領選挙と女王 |
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| 横浜騒乱篇 | 第6巻 -。 第7巻 | ||
| 追憶編 | 第8巻 | ||
| 映画・DVDボーナス | 第8巻.4 – 続・追憶編 – 凍える島 8.5巻 – 11月のハロウィン・パーティ 8.5巻 – 11月のハロウィン・パーティ 8.5巻 – 11月のハロウィン・パーティ 8.5巻 – 11月のハロウィン・パーティ6 – 美少女戦士プラズマリナ |
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| ビジター編 | 9巻 – 10巻 – 。 11巻 | ||
| ダブルセブン編 | 12巻 | ||
| スティープチェイス編 | 13巻 | ||
| SS編 | 13の巻。1: ミキヒコの物語。 龍神の虜 第13.2巻。 英美の物語。 ショットガン！ 第13.3巻。 カノンとシズクの物語。 ひとりでできるもん 第13.4巻。 黒羽ツインズストーリー。 注目を集めるミッション 第13.5巻：エリカとレオの物語。 薔薇の誘惑 |
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| 古都叛乱編 | 第14巻〜第15巻 | ||
| よつばと継承編 | 第16巻 | ||
| 名族会議編 | 第17巻〜第18巻〜 | 名族(めいそう)編 第19巻 | |
| 南海暴動編 | 第20巻 | ||
| 動乱編 | 第21巻〜。 22巻 | ||
| 隔離編 | 23巻 | ||
| 脱出編 | 24巻～の巻。 25巻 | ||
| 侵入編 | 26巻 | ||
| 急変編 | 27巻 | ||
| 追跡編 | 28巻～……。 29巻 | ||
| レスキュー編 | 30巻 | ||
| 未来編 | 31巻 | ||
| 生贄・卒業編 | 32巻 | ||
| 異聞編 | 19巻.5: IF | ||
| マジアンカンパニー | マジアンカンパニー1巻 | ||
| スッピン-。off | 司馬達也暗殺計画（I） 司馬達也暗殺計画（II） 司馬達也暗殺計画（III） シグナスメイデン前日譚 |
雑誌 | ドリームゲーム（SAOとのクロスオーバー前） バーサスII（SAOとのクロスオーバー続編） |