Pour identifier les gènes et les fonctions des gènes qui sous-tendent les aspects clés de la biologie des légumineuses, les chercheurs ont choisi la légumineuse de saison fraîche Medicago truncatula comme système modèle pour la recherche sur les légumineuses. La mission du Consortium M. truncatula est de promouvoir le partage sans restriction des données et des informations fournies par les groupes de recherche Medicago du monde entier. Grâce à l’intégration d’une variété de données et d’outils, le site medicago.org entend faciliter les progrès dans les domaines de la génomique structurelle, comparative et fonctionnelle. Dans ce but, et en tant que partenaire du consortium, le Center for Computational Genomics and Bioinformatics (CCGB) de l’Université du Minnesota a développé MtDB2.0, la version 2.0 de la base de données M. truncatula. La base de données MtDB2.0 est la première étape vers l’intégration globale des informations génomiques, génétiques et biologiques de M. truncatula. MtDB2.0 est une base de données relationnelle qui intègre les données du transcriptome de M. truncatula et offre un large éventail d’options d’exploration de données définies par l’utilisateur. La base de données est interrogée par une série d’interfaces, avec 58 options regroupées en deux filtres. Les identificateurs de séquences de tous les sites publics de M. truncatula sont entièrement référencés afin de faciliter les comparaisons entre différents sites, et des liens hypertextes vers les enregistrements appropriés de la base de données sont fournis pour tous les résultats des requêtes. L’objectif de MtDB est de fournir aux chercheurs les moyens d’identifier rapidement et indépendamment les séquences qui correspondent à des intérêts de recherche spécifiques basés sur des critères définis par l’utilisateur. MtDB2.0 offre un accès illimité à des outils d’interrogation avancés et puissants, inégalés par d’autres bases de données publiques. Les requêtes codées en langage SQL (Structurad Query Language) avec une interface utilisateur Web basée sur Java, intègrent différents filtrages qui permettent une exploration sophistiquée des données des résultats du projet de séquençage des étiquettes de séquences exprimées, y compris l’ensemble Unigene CCGB M. truncatula généré avec l’assembleur Phrap. La base de données sous-jacente et le logiciel d’interrogation ont été conçus pour faciliter les mises à jour et la portabilité vers d’autres organismes modèles. L’accès public à la base de données est à http://www.medicago.org/MtDB.