En bioinformatique, miRBase est une base de données biologiques qui agit comme une archive de séquences et d’annotations de microARN. En septembre 2010, elle contenait des informations sur 15 172 microARN. Ce nombre est passé à 38 589 en mars 2018. Le registre miRBase fournit un système centralisé pour attribuer de nouveaux noms aux gènes de microARN.
microRNA database
Université de Manchester
Ana Kozomara
Kozomara &al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase s’est développée à partir de la ressource de registre de microARN mise en place par Sam Griffiths-Jones en 2003.
Selon Ana Kozomara et Sam Griffiths-Jones, miRBase a cinq objectifs :
- Fournir un système de dénomination cohérent pour les microARN
- Fournir un lieu central rassemblant toutes les séquences de microARN connues
- Fournir des informations lisibles par l’homme et par l’ordinateur pour chaque… microARN
- Fournir des preuves primaires pour chaque microARN
- Agréger et lier à des informations sur les cibles des microARN
MiRBase contient des miRNAs appartenant de diverses espèces appartenant à Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae et Virus. Pour les Viridiplantae, dans la version 21 (2014) les données sont disponibles pour 73 espèces. Cela inclut 4800 miRNA matures uniques et 8480 séquences précurseurs.
La version actuelle de MiRBase est la version 22 (mars 2018).