John Cotton, (né le 4 décembre 1585 à Derby, Derbyshire, Angleterre – mort le 23 décembre 1652 à Boston, Mass. ), influent leader puritain de la Nouvelle-Angleterre qui servit principalement comme « professeur » de la première église de Boston (1633-52) après avoir échappé à la persécution des non-conformistes par l’Église d’Angleterre.
Éduqué au Trinity College de Cambridge, Cotton devient vicaire de l’église paroissiale de St Botolph à Boston, dans le Lincolnshire, en 1612 et reste à ce poste pendant 21 ans. Pendant cette période, il devient progressivement plus puritain dans ses idées et cesse d’observer certains rituels religieux anglicans dans l’exercice de ses fonctions. En 1632, des poursuites judiciaires sont engagées contre lui en raison de son non-conformisme et, en juillet 1633, il émigre dans la colonie de la baie du Massachusetts, où il devient « professeur » de la première église de Boston et le restera jusqu’à sa mort. Sa popularité dans la colonie était sans bornes, et son influence dans les affaires civiles et ecclésiastiques était probablement plus grande que celle de tout autre ministre dans la Nouvelle-Angleterre théocratique.
Cotton a écrit plusieurs ouvrages qui constituent une exposition inestimable du congrégationalisme de la Nouvelle-Angleterre, notamment The Way of the Churches of Christ in New England (1645) et The Way of Congregational Churches Cleared (1648). Le catéchisme qu’il a écrit, Milk for Babes, Drawn out of the Breasts of Both Testaments (1646), a été largement utilisé pendant de nombreuses années en Nouvelle-Angleterre pour l’instruction religieuse des enfants.