Les premiers soupçons, parmi les théoriciens, se sont portés sur un certain Edwin Decker, qui avait eu une brève rencontre amoureuse avec Michelle deux nuits avant que son corps ne soit retrouvé. Les soupçons se sont portés sur Decker après qu’il ait écrit un poème mystérieux et morbide sur Michelle après sa mort.

Un autre suspect potentiel a été révélé lorsqu’un collègue de travail dans un magasin de fournitures de bureau où Michelle avait travaillé auparavant a vu un homme faire plusieurs copies du rapport d’autopsie original peu après la fin de l’enquête. Ce collègue a affirmé que l’homme avait une moto. Cette dernière théorie de suspect est liée à un harceleur sur le lieu de travail dont Michelle s’est un jour plainte, qui possédait également une moto.

Pour ajouter aux spéculations sur un possible scénario de meurtre, le fait que ses vêtements n’ont jamais été retrouvés et que son sac à main, avec de l’argent et d’autres objets intacts, a été retrouvé dans un endroit évident non loin de là.

À l’instigation d’Edwin Decker et du journaliste Neal Matthews, le rapport d’autopsie de Michelle a été réexaminé en 2008 par le nouveau médecin légiste en chef Glen Wagner qui, selon un article de Decker, a conclu qu’il semblait y avoir des preuves douteuses mais pas assez pour justifier la modification de son certificat de décès.

Le cas de Michelle a été profilé dans Buzzfeed Unsolved, une série de mystère sur YouTube passant en revue les détails de son cas. Les animateurs Ryan Bergara et Shane Madej ont noté des détails suspects dans l’autopsie de Michelle, et ont développé trois théories principales pour la mort de Michelle : 1. Que Michelle a effectivement été attaquée par un requin, 2. Que Michelle a sauté et a ensuite été nourrie par les requins, ou 3. Que Michelle a été assassinée, peut-être par un intérêt amoureux repoussé ou par un harceleur sans nom.

Si l’opinion dominante veut que von Emster ait été victime d’une attaque de requin, les autorités sur place n’avaient jamais enquêté sur un décès par attaque de requin auparavant, et n’étaient donc peut-être pas qualifiées pour se prononcer sur la cause du décès. En outre, lorsqu’on a montré le corps aux experts, certains ont affirmé que les blessures ne correspondaient pas aux mensurations d’un grand requin blanc. Officiellement, l’affaire est close, mais le cas de la mort de Michelle von Emster reste un mystère pour ceux qui ne sont pas d’accord avec la cause officielle du décès : une attaque de grand requin blanc.

À l’heure actuelle, le Global Shark Attack File ne reconnaît pas l’incident de von Emster comme une attaque de requin mortelle.