Gene Expression Heterogeneity

Joseph Rodriguez, Ph.D.
Principal Investigator Tel 984-287-3104
[email protected]

Tutkimuksen yhteenveto

Nykyisen tekniikan avulla ryhmä voi kuvata transkriptiokohteita tosiajassa, mikä johtaa ymmärrykseen siitä, miten geenien ilmentymisen heterogeenisuutta säädellään.

Filosofian tohtori Joseph Rodriguez johtaa yksittäisten solujen dynamiikkaryhmää, ja hänellä on sivutoimi NIEHSin signaalitransduktiolaboratoriossa. Single Cell Dynamics -ryhmä tutkii, miten ympäristö vaikuttaa ilmentymisen vaihteluun yksittäisen solun tasolla ja myöhemmin sitä, miten tämä vaihtelu vaikuttaa solun kohtaloa koskeviin päätöksiin.

Ryhmän käsitys geenien säätelystä perustuu enimmäkseen tutkimuksiin, joissa tutkitaan kokonaisia kudoksia ja irtosolulysaatteja. Single Cell Dynamics -ryhmä on kiinnostunut ymmärtämään, miksi geneettisesti identtiset solut reagoivat heterogeenisesti ympäristön ärsykkeisiin. Viimeaikaiset tutkimukset viittaavat siihen, että sairauksissa, kuten syövässä tai ikääntymisprosessissa, ekspression vaihtelu lisääntyy kudoksissa. Tätä vaihtelua säätelevien tekijöiden ja mekanismien selvittäminen auttaa meitä ymmärtämään normaalien ja sairaiden tilojen välisiä eroja.

Tutkimuksen pääalueet:

• Ekspression heterogeenisuuden mekanismien määrittäminen
• Ekspression heterogeenisuuden mekanismien määrittäminen
• Solun kohtaloa koskevien päätösten säätely yksittäisissä soluissa

Transkription kuvantaminen elävillä soluilla paljastaa syviä repressiivisiä jaksoja, jotka aiheuttavat ekspression heterogeenisuutta.

Rodriguez valmistui MIT:stä vuonna 2001 ja työskenteli kuusi vuotta bioinformatiikan analyysin parissa ihmisen genomin kokoamisessa. Vuonna 2007 hän aloitti työn Nobel-palkitun tohtori Michael Rosbashin johdolla Brandeisin yliopistossa tutkimalla RNA:n prosessointia ja sirkadiaanisen geeniekspression dynamiikkaa. Nämä työt johtivat yhdentoista julkaisun yhteisiin kirjoittajiin, mukaan lukien ensimmäisenä kirjoittajana julkaistut artikkelit Molecular Cell -lehdessä ja Proceedings of the National Academy of Sciences -lehdessä. Saatuaan tohtorintutkinnon vuonna 2012 Rodriguez liittyi tohtori Daniel Larsonin laboratorioon National Cancer Instituteen ja tutki estrogeenille reagoivien geenien transkriptiosäätelyä yksittäisissä ihmissoluissa. Hän liittyi NIEHSiin vuonna 2018.