Ei tiedetä mitä tapahtui.

Me tiedämme mitä ei tapahtunut. Suosittu faniteoria on, että tapahtui jonkinlainen Cataclysm, jossa Zero pääsi irti ja tappoi kaikki. Keiji Inafune itse on nimenomaisesti torjunut tämän.

Wilyn oletetaan selvinneen Maverick-viruksen kautta ja hän on ehdottomasti se, joka loi sen ja Zeron. Siitä ei ole ainakaan mitään epäilystä.

Jos pitäisi arvata:Roll luultavasti päätyi kulumaan myöhemmin.

Blues/Protoman todennäköisesti kuoli energiaepätasapainoonsa.

On todennäköistä että Megaman ja Forte/Bass tappoivat lopulta toisensa.

Lightin terveys oli ilmeisesti heikentynyt Day of Sigman flashbackeissa, joten on todennäköistä, että hän yksinkertaisesti kuoli luonnollisiin syihin.

On vahvasti vihjailtu, muttei koskaan vahvistettu, että Wily latasi mielensä tietokoneelle.

Vaihtoehtoinen kohtalo Megamanille voisi olla tämä: Yksi tohtori Wilyn robottimestareista on Quint, uudelleenohjelmoitu versio Megamanista, jonka Wily varasti 34 vuoden päästä tulevaisuudesta. Tuolloin Megamanin taistelu oli päättynyt ja häneltä oli poistettu taisteluosat, joten Wily antoi hänelle uudet yrittäessään tappaa menneen minänsä. Ilmeisesti Megaman voitti hänet, mutta, ja tämä menee muistin varassa, minulla ei ole yhtään mitään, mikä tukisi tätä, olen melko varma, että Quint ei oikeasti tuhoutunut.

En ole varma, mitä siinä tapahtui.