Kliinistä lääketiedettä palvelevat ensisijaisesti Bodleian Health Care Libraries -kirjastot neljässä toimipisteessä, joissa on ajankohtaisen aineiston kokoelmia. Bodleian Health Care Libraries palvelee sekä yliopiston että paikallisen NHS:n henkilökuntaa. Erikoisalat ovat seuraavat:

Cairns Library, John Radcliffe Hospital: Akuutti yleislääketiede/kirurgia (kaikki tieteenalat), synnytys- ja naistentautioppi, lastentautioppi, geratologia, AIDS, neurotieteet, korva- ja nielutautioppi, silmätautioppi ja kurssikirjat.

Knowledge Centre, Old Road Campus Research Building: Epidemiologia, näyttöön perustuva terveydenhuolto, terveyspolitiikka, kansanterveyslääketiede, tilastot, diabetes, onkologia, sädehoito.

NOC Library, Nuffield Orthopaedic Centre: Ortopedia, tuki- ja liikuntaelinsairaudet, reumatologia, neurologiset sairaudet ja neurokuntoutus, ortopedia, proteesit, fysioterapia, toimintaterapia, terveysjohtaminen ja hoitotyö.

Horton Library, Horton General Hospital: Yleislääketiede, synnytykset ja naistentaudit, sairaanhoito ja kätilötyö, neonatologia, gastroenterologia ja hepatologia, lastenlääketiede, gerontologia, kardiologia, hengityslääketiede, traumatologia ja ortopedia, endokrinologia, psykiatria ja mielenterveys, psykologia, päivystyslääketiede, tehohoitolääketiede, kirurgia ja anestesiatiede, patologia, mikrobiologia ja terveysjohtaminen.

Ei-kliinistä lääketiedettä palvelee ensisijaisesti Radcliffe Science Library. Sen laajat biotieteiden ja lääketieteen kokoelmat ovat peräisin 1800-luvulta, ja niihin kuuluu sekä historiallisesti että nykyaikaisesti kiinnostavaa lakisääteistä talletusta ja ostettua aineistoa. Se kerää lakisääteistä talletusmateriaalia kliinisen lääketieteen alalta sekä lakisääteistä talletusmateriaalia ja ostettua materiaalia ei-kliinisistä aiheista, kuten kokeellisesta psykologiasta, ihmisen anatomiasta ja genetiikasta, fysiologiasta, patologiasta ja farmakologiasta.