Vuonna 1775 Biddle palasi Pohjois-Amerikkaan tarjotakseen palveluksiaan Pennsylvanian osavaltiolle Britannian vallan vastustamisessa. Yhdysvaltain vapaussodan puhjettua Pennsylvanian turvallisuuskomitea asetti Biddlen aseistetun kaleeri Franklinin komentajaksi. Joulukuussa 1775 Biddle määrättiin Manner-Euroopan laivaston palvelukseen ja hänestä tuli 14-tykkisen priki Andrew Dorian kapteeni.

Biddle osallistui retkikuntaan New Providencea vastaan ja taisteli Manner-Euroopan laivaston taistelussa HMS Glasgow’n kanssa 6. huhtikuuta 1776. Biddle suhtautui toimintaan erittäin kriittisesti ja totesi, että kommodori Esek Hopkinsin puutteelliset merkinantoilmoitukset johtivat ”sekasortoiseen” toimintaan. Biddle kaappasi myöhemmin lukuisia aluksia, mukaan lukien brittiläisen armeijan kuljetusaluksia, myöhemmillä risteilyillä.

Biddle osallistui myöhemmin Newfoundland Banksin risteilylle, joka onnistui laivojen kaappaamisessa niin hyvin, että Biddlen palatessa satamaan hänen aluksessaan oli enää viisi merimiestä; loput miehittivät risteilyn aikana kaapattuja ryöstösaaliita.

Kesäkuun 6. päivänä 1776 Mannerheimin liittokokous nimitti Biddlen komentajaksi Randolphin, joka oli tuolloin rakennettavana Philadelphiassa, ja joka oli nimeltään 32-yksityistykkinen fregatti. Se laskettiin vesille lähellä vuoden loppua, ja se purjehti alkuvuodesta 1777. Syyskuussa 1777 Biddle kaappasi HMS True Britonin ja sen kolmen aluksen saattueen.

7. maaliskuuta 1778 Barbadosin edustalla Randolph otti yhteen brittiläisen 64-tykkisen HMS Yarmouthin kanssa. Sen sijaan, että Randolph olisi yrittänyt paeta raskaammin aseistettua vastustajaa, hän ryhtyi taisteluun suojellakseen amerikkalaista kauppasaattuetta. Silminnäkijä kertoi, että fregatti pärjäsi parinkymmenen minuutin taistelun aikana ja näytti ”ampuvan neljä tai viisi leveälaidallista Yarmouthin yhtä vastaan”. Biddlen haavoittumisen jälkeen Randolph räjähti yllättäen ja tappoi kaikki paitsi neljä aluksella olleista 305:stä, Biddle mukaan lukien. Randolphin menetys oli vakava isku Manner-Euroopan nuorelle laivastolle. Hänen ruumiinsa katosi mereen, eikä sitä koskaan löydetty.

Hänen veljensä Edward Biddle oli Yhdysvaltain itsenäisyyden vankka puolestapuhuja, ja hänen veljenpoikansa Nicholas Biddle oli arvostettu pankkiiri.

Neljä Yhdysvaltain laivaston alusta on nimetty hänen kunniakseen USS Biddle -alukseksi.

Cyrus Townsend Bradyn kirja Rakkaudesta isänmaahansa (For Love of Country) pohjautuu osittain Nicholas Biddlen elämäntarinaan.