Bioinformatiikassa miRBase on biologinen tietokanta, joka toimii mikroRNA-sekvenssien ja merkintöjen arkistona. Syyskuussa 2010 se sisälsi tietoa 15 172 mikroRNA:sta. Määrä on noussut 38 589:ään maaliskuuhun 2018 mennessä. MiRBase-rekisteri tarjoaa keskitetyn järjestelmän uusien nimien antamiseksi mikroRNA-geeneille.
microRNA database
University of Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase kasvoi Sam Griffiths-Jonesin vuonna 2003 perustamasta mikroRNA-rekisteriresurssista.
Ana Kozomaran ja Sam Griffiths-Jonesin mukaan miRBasella on viisi tavoitetta:
- Tarjota johdonmukainen nimeämisjärjestelmä mikroRNA:ille
- Tarjota keskitetty paikka, johon kerätään kaikki tunnetut mikroRNA-sekvenssit
- Tarjota ihmiselle ja tietokoneelle luettavaa tietoa jokaisesta mikroRNA:sta. mikroRNA
- Tarjoamaan ensisijaista näyttöä jokaisesta mikroRNA:sta
- Kokoamaan ja linkittämään mikroRNA:n kohdetietoja
MiRBase sisältää miRNA:ita, jotka kuuluvat Alveolata-lajiin kuuluviin eri lajeihin, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae ja Viruses. Viridiplantae-lajin osalta julkaisussa 21 (2014) tietoja on saatavilla 73 lajista. Tämä sisältää 4800 ainutlaatuista kypsää miRNA:ta ja 8480 esiastesekvenssiä.
MiRBasen nykyinen versio on julkaisu 22 (maaliskuu 2018).