Titus Flavius Clemensina syntyneen Klemens Aleksandrialaisen syntymäaikaa ja -paikkaa ei tiedetä, mutta on todennäköistä, että hän syntyi vuosikymmenellä 150-160, mahdollisesti Ateenassa. Opiskeltuaan uskonnollisten ja filosofisten opettajien luona Kreikassa, Etelä-Italiassa ja Syyriassa hän asettui asumaan egyptiläiseen Aleksandrian kaupunkiin. Siellä häneen teki syvän vaikutuksen stoalaisuudesta kristinuskoon kääntyneen Pantaenoksen opetus, joka oli tuolloin Aleksandrian kristillisen katekeettisen koulun johtaja. Klemens, joka pysyi maallikkona, tuli lopulta Pantaenoksen seuraajaksi tähän virkaan, ja hän hoiti virkaa useita vuosia, luultavasti korkeintaan kymmenen vuotta. Kristillisenä opettajana toimimiseensa liittyen Klemens tuotti kolme tärkeintä kirjoitustaan: Kehotus kääntymykseen, Opettaja ja Sekatyö.

Aleksandriassa Klemens oli yhdessä hellenistisen maailman johtavista älyllisistä keskuksista. Erittäin spekulatiiviset ja harhaoppiset gnostilaiset kristillisen ajattelun muodot olivat olleet siellä vuosikymmenien ajan näkyvästi esillä niiden keskuudessa, jotka tunnustivat mitä tahansa kristinuskon muotoa. Gnostilaisuus itsessään edusti yhtä tapaa syntetisoida kristillinen usko ja hellenistinen kulttuuri. Klemens oli vakuuttunut siitä, että kreikkalainen filosofia, erityisesti platoninen metafysiikka ja stoalainen etiikka, oli yksi niistä tavoista, joilla Jumala oli valmistanut maailman Kristuksen tuloa varten. Hänen tehtävänään oli siis työskennellä kreikkalaisen ajattelun ortodoksisen kristillisen omaksumisen puolesta.

Lukija aistii Klemensin kirjoituksissa kolmen kriitikkoryhmän läsnäolon, joita vastaan hän jatkuvasti puolustautuu. Klassisen kulttuurin pakanallisille edustajille hän perustelee kaikenlaisen ”uskon” ja erityisesti kristillisen uskon puolustettavuutta. Harhaoppisille kristillisille gnostikoille hän osoittaa, että kokemus lunastuksesta Kristuksessa ei merkitse Jumalan luoman aineellisen maailman arvon alentamista. Yksinkertaisille ja ortodoksisille kristityille hän antaa vakuutuksen siitä, että usko ja älyllinen hienostuneisuus eivät ole yhteensopimattomia ja että filosofia ei johda väistämättä gnostilaiseen harhaoppiin.

Klemens lähti Aleksandriasta kristittyihin kohdistuneen vainon puhjetessa vuonna 202. Hänet nähdään ohimennen Syyriassa pian sen jälkeen. Vielä myöhemmin hän esiintyy vanhan oppilaansa seurassa, joka on nyt piispana Vähässä-Aasiassa; piispa lähettää vanhalle opettajalleen onnittelukirjeen juuri valitulle Antiokian piispalle. Yleisesti ajatellaan, että Klemens kuoli noin vuonna 215.