Kuten muillakin Keski-Amerikan kannaksilla, Hondurasilla ei ole ollut helppoa. Sillä on ollut väkivaltainen ja myrskyisä historia.

Hondurasin elämäntarina alkaa jo silloin, kun ihmiset vaelsivat Pohjois-Amerikasta Etelä-Amerikkaan käyttäen Keski-Amerikkaa maasiltana. Matkan varrella monet päätyivät jäämään. Eri puolilta aluetta löydetyt artefaktit osoittavat, että ihmiset olivat alueella 12 000 eaa. ja 8 000 eaa. välisenä aikana.

Seuraavien muutaman tuhannen vuoden ajan Hondurasissa asui eri etnisiä ryhmiä, jotka olivat hajallaan ympäri maata. Vuoteen 150 jKr. mennessä mayojen sivilisaatio oli vallannut Hondurasin pohjois- ja länsipuoliset alueet Guatemalassa, Meksikossa ja Belizessä.

Maiat olivat levittäytyneet läntisen Hondurasin puolelle, ja he perustivat Copanin kaupungin. Copan ja läntinen Honduras merkitsivät mayojen levinneisyysalueen laajuutta sen ydinalueelta. Se ei kuitenkaan estänyt sitä nousemasta mayamaailman merkittäväksi keskukseksi.

Etuklassisella kaudella, 2000 eaa. – 200 jKr., mayat saapuivat ensimmäisen kerran Länsi-Hondurasiin. Mutta Copan pääsi oikeuksiinsa klassisella kaudella. Noin 400 jKr. ja 800 jKr. välisenä aikana Copan oli huipussaan maya-kuningaskunnan vertaansa vailla olevana päämiehenä.

Vuodesta 800 jKr. lähtien kaupunki romahti. Hallitseva eliitti lähti Copanista, ja kaupunki raunioitui vähitellen, kun ihmiset varastivat kiviä omaa rakentamistaan varten. Copanin kohtalo oli mikroversio koko mayasivilisaation kohtalosta.

Pääosa Hondurasista ei ollut mayojen hallinnassa, vaikka naapurikansat ja -heimot kävivät kauppaa Copanin kanssa ja taistelivat sen kanssa. Copanin romahduksen jälkeiset vuosisadat, jotka johtivat espanjalaisten saapumiseen, kulkivat hämärässä, kun kukin kansakunta hoiti omia asioitaan.

Asiat muuttuivat lopullisesti 30. heinäkuuta 1502. Tuolloin Kristoffer Kolumbus laskeutui neljännellä ja viimeisellä matkallaan Uuteen maailmaan Guanajan saarelle, joka on yksi Hondurasin lahden saarista. Hän oli ensimmäinen eurooppalainen, joka saapui Keski-Amerikkaan.

Muutamaa viikkoa myöhemmin, 14. elokuuta, Kolumbus astui ensimmäisenä eurooppalaisena jalan Keski-Amerikan mantereelle, lähelle Trujilloa. Kolumbus nimesi tämän maan Hondurasiksi, mikä tarkoittaa ”syvyyksiä”. Uskotaan, että hän viittasi rannikon edustalla olevien vesien syvyyksiin.

Kolumbus ei viipynyt Hondurasissa pitkään. Hän suuntasi itään rannikkoa pitkin ja alas tutustumaan Nicaraguaan, Costa Ricaan ja Panamaan ennen kuin hän palasi takaisin Santo Domingoon. Amerikan mantere oli nyt espanjalaisten tutkassa.

Kun espanjalaiset valloittivat atsteekit Meksikossa pohjoisessa ja taistelivat tiensä Panamasta etelään seuraavien noin kahdenkymmenen vuoden aikana, kävi ilmeiseksi, että he kaikki kohtaisivat jossain. Tuo paikka oli Honduras, jossa eri suunnista tulleet kilpailevat espanjalaiset valloittajat taistelivat toisiaan sekä alkuperäiskansoja vastaan saadakseen maan haltuunsa.

Gil Gonzales Davila saapui pohjoisrannikolta toivoen pääsevänsä takaisin alas kohti Nicaraguaa, jonka hän oli jo valloittanut. Sillä välin Hernan Cortes, tuoreena Meksikon valloituksestaan, etsi uusia haasteita. Cortes lähetti Cristobal de Olidin Hondurasiin lännestä. Mukana oli myös Francisco Hernandez de Cordoba, joka oli tulossa Nicaraguasta, jonka hän oli myös valloittanut kilpaillessaan Davilan kanssa. Kukaan näistä kavereista ei pitänyt toisistaan kovinkaan paljon, ja he kaikki halusivat Hondurasin itselleen.

Cortesin mies Olid riehui Hondurasissa ja yritti ottaa maan itselleen eikä Espanjan kruunulle. Tämä tarkoitti sitä, että Cortes saapui paikalle omien joukkojensa kanssa. Nyt Hondurasissa oli neljä kilpailevaa espanjalaisjoukkoa, jotka taistelivat toisiaan vastaan paikallisten valloittamisen välillä. Monien espanjalaisten välisten, suoranaista sisällissotaa lähentelevien kahakoiden jälkeen Olid teloitettiin lopulta. Santo Domingosta lähetetyt välikädet auttoivat vakiinnuttamaan espanjalaisten läsnäolon Cortesin johdolla vuonna 1525.

Cortesin hallitessa espanjalaisia Hondurasissa asiat etenivät nopeasti. Trujillon kaupunki perustettiin vuonna 1525, ja Cortes saapui maahan Meksikosta pian sen jälkeen. Hänen saapumisensa oli piristysruiske espanjalaisille sotilaille ja uudisasukkaille Hondurasissa. Siitä eteenpäin vuoteen 1539 asti valloitus eteni espanjalaisten kannalta sujuvammin.

Vuoteen 1539 mennessä Honduras oli osa Espanjan valtakuntaa Guatemalan kenraalikapteeniston valvonnassa.

Koska Honduras kuului kenraalikapteenistoon, Honduras oli tärkeä. Toisin kuin useimmissa muissa Keski-Amerikan osissa, joista espanjalaiset eivät löytäneet aarteita, Hondurasissa oli hopeaa.

Koko Keski-Amerikan alkuperäisväestö saapui (ei omasta tahdostaan) työskentelemään kaivoksiin, samoin kuin myöhemmin orjia Afrikasta. Hondurasista tuli varsin varakas muuhun Keski-Amerikkaan verrattuna, ja Tegucigalpan kaupunki perustettiin vuonna 1578 kaivosalueelle.

Espanjan hallinto keskittyi aina hopeakaivosalueiden ympärille, Hondurasin keskiosaan, pois Karibian rannikolta. Kun hopeakaivosten merkitys kasvoi, espanjalaiset siirtyivät sisämaahan ja jättivät rannikon vartioimatta. Huolimatta siitä, että espanjalaiset saapuivat Karibianmeren rannikolle heti alusta alkaen, valloituksen alettua he eivät koskaan onnistuneet valloittamaan tätä aluetta kokonaan. Tämä osa Hondurasia, mukaan lukien Baysaaret, jäi espanjalaisten vaikutusvallan ulkopuolelle.

Kun espanjalaiset siirtyivät pois, muut siirtyivät sinne merirosvojen muodossa, jotka olivat enemmän tai vähemmän ottaneet hallintaansa Baysaaret, joita he käyttivät tukikohtanaan. Myös britit astuivat kuvaan mukaan ja tukivat Miskito-heimoa espanjalaisia vastaan.

Espanjalaiset eivät olleet koskaan valloittaneet Miskitoja. Kun he olivat liittoutuneet brittien kanssa, se avasi briteille mahdollisuuden vallata koko Keski-Amerikan Karibianmeren rannikko. Tätä aluetta kutsuttiin Mosquito-rannikoksi.

Vuonna 1821 Meksiko itsenäistyi Espanjasta ja sen myötä Guatemalan kenraalikapteenisto, johon Honduras kuului. Kaksi vuotta sen jälkeen kenraalikapteenisto irrottautui Meksikosta, ja Keski-Amerikka jatkoi toimintaansa yksin.

Keski-Amerikan liittotasavalta ei itsekään kestänyt kovin kauan. Muutaman vuoden myllerryksen jälkeen se hajosi vuonna 1839, ja jokainen sen maakunta itsenäistyi. Honduras oli nyt suvereeni valtio.

Hondurasin itsenäistymisen ironiaa oli se, että kaikista Keski-Amerikan maista juuri Honduras ajoi eniten Keski-Amerikan pysymistä yhtenäisenä.

Honduras yritti itsenäistymisensä jälkeenkin useita kertoja taivutella muita maita liittymään yhteen, mutta turhaan. Hondurasin lipun viisi tähteä, yksi kutakin maata kohti, ovat osoitus siitä, että Honduras näki itsensä pikemminkin osana suurempaa Keski-Amerikkaa kuin omana maanaan. Sen vuoksi se on alueella ainutlaatuinen.

Mutta Honduras oli yksin, halusipa se tai ei. Se alkoi piirtää omaa kurssiaan.

Yksi ensimmäisistä asioista, joita Honduras teki olemassaolonsa parin ensimmäisen vuosikymmenen aikana, oli kutsua maahan ulkomaisia investointeja auttamaan maan talouden rakentamisessa. Ulkomaiset yhtiöt Euroopasta ja Yhdysvalloista tulivat Hondurasiin ja alkoivat rakentaa rautateitä ja kuljettaa hedelmiä.

20. vuosisadan alkuun mennessä Honduras oli luovuttanut laajoja alueita maastaan United Fruitin kaltaisille suuryrityksille vastineeksi niiden tarjoamasta työvoimasta ja rakentamasta infrastruktuurista.

Näistä hedelmäyhtiöistä tuli niin vaikutusvaltaisia Hondurasin elämän kaikilla osa-alueilla, että Hondurasia kutsuttiin ensimmäiseksi todelliseksi ”banaanitasavallaksi”. Yhtiöt kontrolloivat Hondurasin presidenttejä ja poliitikkoja. Maa oli käytännössä oligarkia.

Työntekijöiden oikeudet olivat Hondurasissa minimaaliset, sillä hedelmäyhtiöiden tulos oli kaikkivoipa. Uudistukset hyväksyttiin, otettiin pois ja hyväksyttiin uudelleen.

Kun työläiset saivat järjestäytymisoikeuden 1950-luvulla, massiivinen yleislakko johti siihen, että United Fruitin tukema armeija syrjäytti työläisiä myötämielisesti suhtautuneen demokraattisesti valitun presidentin Villeda Moralesin ja asetti maahan diktatuurin, joka kesti 1980-luvun alkupuolelle asti.

Diktatuurin aikana Honduras puuttui ankarasti työläisten oikeuksiin ja vasemmistoryhmiin. Moralesin United Fruitin työntekijöille tekemät uudistukset mitätöityivät. Ammattiliitot joutuivat ahdistelun kohteeksi.

Hondurasin sotilashallituksesta tuli Yhdysvaltojen vankka liittolainen taistelussa kommunismia vastaan Latinalaisessa Amerikassa.

Vuonna 1969 Honduras kävi lyhyen mutta verisen sodan El Salvadorin kanssa, jota kutsuttiin Jalkapallosodaksi (The Football War), koska se sattui samaan aikaan, kun näiden kahden maan välillä pelattiin joitakin jalkapallon jalkapallon MM-kilpailujen karsintoja. Todellinen syy oli se, että Hondurasissa asui paljon salvadorilaisia maahanmuuttajia, joita hedelmäyhtiöiden työt houkuttelivat.

Talouden ollessa vaikeuksissa sotilashallitus halusi syntipukin, ja niinpä se syytti maahanmuuttajia. El Salvador vastasi, ja sota alkoi neljän päivän aikana heinäkuussa 1969. Vaikka sota päättyi tasapeliin, se merkitsi käännekohtaa sotilashallituksen kohtalossa. Monet ihmiset, jotka aikoinaan kannattivat sitä, kääntyivät nyt. Todellisia oppositiopuolueita muodostui, ja 1970-luvusta tuli asteittaisten uudistusten vuosikymmen, jota seurasi takaisku, jota seurasi asteittainen uudistus. Pienin askelin.

Vuonna 1981 Hondurasiin palasi siviilihallinto. Uusi perustuslaki kirjoitettiin, ja hedelmäyhtiöt, joiden kukoistuskausi oli jo kauan sitten ohi, löysivät itsensä vailla valtaa. Kaikkialta maailmasta saadun avun avulla Honduras alkoi uudistaa itseään. Tänä aikana Hondurasista tuli Peace Corp:n suurin kohdemaa.

Ei 80-luvulla ollut kuitenkaan kaikki ruusuista. Uusi hallitus pelkäsi Hondurasin joutuvan kommunistien hallintaan kuten naapurinsa Nicaragua. Sen muut naapurit Guatemala ja El Salvador olivat myös itse kietoutuneet sisällissotiin, eikä Honduras halunnut lähteä samalle tielle.

Yhdysvallat eivät myöskään halunneet toista vasemmistohallintoa Isthmusille.

Hondurasin armeija aloitti kuitenkin pienimuotoiset pelottelukampanjat maan vasemmistoryhmittymiä vastaan, joihin kuului myös kuolemanpartioiden käyttö.

Keski-Amerikan sisällissodat päättäneet rauhansopimukset lopettivat suurimmaksi osaksi sorron myös Hondurasissa.

Vuonna 1998 maan pyyhkäisi lähes kokonaan pois hurrikaani Mitch, joka tuhosi noin 70 prosenttia Hondurasin maataloudesta ja 80 prosenttia sen infrastruktuurista. Sanottiin, että Hondurasin 50 vuoden edistys oli kääntynyt päinvastaiseksi, mikä vei maan takaisin 1940-luvulle.

Sen jälkeen Honduras on jälleenrakennettu. Asiat alkoivat vaikeutua vuonna 2009, kun silloinen presidentti Manuel Zelaya syrjäytettiin, koska hän yritti muuttaa perustuslakia, jotta hän voisi asettua uudelleen ehdolle. Armeija otti vallan hetkeksi haltuunsa ennen kuin se palautti vallan takaisin kansalle.