Para identificar los genes y las funciones de los genes que subyacen a los aspectos clave de la biología de las legumbres, los investigadores han seleccionado la legumbre de estación fría Medicago truncatula como sistema modelo para la investigación de las legumbres. La misión del Consorcio M. truncatula es promover el intercambio sin restricciones de los datos y la información que proporcionan los grupos de investigación de Medicago en todo el mundo. Mediante la integración de una variedad de datos y herramientas, el sitio medicago.org pretende facilitar el progreso en los campos de la genómica estructural, comparativa y funcional. Con este objetivo, y como socio del consorcio, el Centro de Genómica Computacional y Bioinformática (CCGB) de la Universidad de Minnesota ha desarrollado MtDB2.0, la base de datos de M. truncatula versión 2.0. La base de datos MtDB2.0 es el primer paso hacia la integración global de la información genómica, genética y biológica de M. truncatula. MtDB2.0 es una base de datos relacional que integra los datos del transcriptoma de M. truncatula y proporciona una amplia gama de opciones de extracción de datos definidas por el usuario. La base de datos se consulta a través de una serie de interfaces, con 58 opciones agrupadas en dos filtros. Los identificadores de secuencias de todos los sitios públicos de M. truncatula tienen referencias cruzadas completas para facilitar las comparaciones entre diferentes sitios, y se proporcionan enlaces de hipertexto a los registros apropiados de la base de datos para todos los resultados de las consultas. El objetivo de MtDB es proporcionar a los investigadores los medios para identificar de forma rápida e independiente las secuencias que coinciden con los intereses de investigación específicos basados en los criterios definidos por el usuario. MtDB2.0 ofrece un acceso sin restricciones a herramientas de consulta avanzadas y potentes que no tienen parangón con ninguna otra base de datos pública. Las consultas codificadas en Structurad Query Language (SQL) con una interfaz de usuario web basada en Java, incorporan diferentes filtros que permiten una sofisticada extracción de datos de los resultados del proyecto de secuenciación de etiquetas de secuencias expresadas, incluido el conjunto Unigene de M. truncatula CCGB generado con el ensamblador Phrap. La base de datos subyacente y el software de consulta han sido diseñados para facilitar las actualizaciones y la portabilidad a otros organismos modelo. El acceso público a la base de datos está en http://www.medicago.org/MtDB.