La medicina clínica es atendida principalmente por las Bibliotecas de Salud Bodleian en cuatro sitios que albergan colecciones de material actual. Las Bodleian Health Care Libraries atienden tanto al personal de la Universidad como al del NHS local. Las especialidades son las siguientes:

Biblioteca Cairns, Hospital John Radcliffe: Medicina general/cirugía de agudos (todas las disciplinas), obstetricia y ginecología, pediatría, geratología, SIDA, neurociencias, otorrinolaringología, oftalmología y libros de texto.

Knowledge Centre, Old Road Campus Research Building: Epidemiología, Atención sanitaria basada en la evidencia, Política sanitaria, Medicina de la salud pública, Estadística, Diabetes, Oncología, Radioterapia.

Biblioteca NOC, Centro Ortopédico Nuffield: Ortopedia, Ciencias Musculoesqueléticas, Reumatología, Enfermedades Neurológicas y Neurorehabilitación, Ortesis, Prótesis, Fisioterapia, Terapia Ocupacional, Gestión Sanitaria y Enfermería.

Biblioteca Horton, Hospital General Horton: Medicina General, Obstetricia y Ginecología, Enfermería y Partería, Neonatología, Gastroenterología y Hepatología, Pediatría, Gerontología, Cardiología, Medicina Respiratoria, Traumatología y Ortopedia, Endocrinología, Psiquiatría y Salud Mental, Psicología, Medicina de Emergencia, Medicina de Cuidados Intensivos, Cirugía y Anestesia, Patología, Microbiología y Gestión Sanitaria.

La medicina no clínica está atendida principalmente por la Radcliffe Science Library. Sus extensas colecciones en Ciencias de la Vida y Medicina datan del siglo XIX, incluyendo material de depósito legal y adquirido de interés histórico y contemporáneo. Recoge el material de depósito legal en medicina clínica, y el material de depósito legal y comprado en materias no clínicas como Psicología Experimental, Anatomía Humana y Genética, Fisiología, Patología y Farmacología.