Nanoscale Molecular Dynamics (NAMD, anteriormente Not Another Molecular Dynamics Program) es un software informático para la simulación de dinámica molecular, escrito utilizando el modelo de programación paralela Charm++. Destaca por su eficacia paralela y suele utilizarse para simular sistemas de gran tamaño (millones de átomos). Ha sido desarrollado por la colaboración del Grupo de Biofísica Teórica y Computacional (TCB) y el Laboratorio de Programación Paralela (PPL) de la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign.

Dinámica molecular a nanoescala

Desarrollador(es)

Universidad de Illinois en Urbana-Champaign: Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB), Parallel Programming Laboratory (PPL)

Liberación inicial

1995; hace 26 años

Liberación estable

Repositorio

Escrito en

C++

Sistema operativo

Cruzado: Windows, Linux, macOS, Unix

Plataforma

x86, x86-64

Disponible en

Inglés

Tipo

Simulación de dinámica molecular

Licencia

Propia, freeware para uso no comercial

Sitio web

www.ks.uiuc.edu/Research/namd

Fue introducido en 1995 por Nelson et al. como un código de dinámica molecular en paralelo que permite la simulación interactiva mediante el enlace con el código de visualización VMD. Desde entonces, NAMD ha madurado, añadiendo muchas características y escalando más allá de 500.000 núcleos de procesador.

NAMD tiene una interfaz con los paquetes de química cuántica ORCA y MOPAC, así como una interfaz con scripts para muchos otros paquetes cuánticos. Junto con Visual Molecular Dynamics (VMD) y QwikMD, la interfaz de NAMD proporciona acceso a simulaciones QM/MM híbridas en una suite integrada, completa, personalizable y fácil de usar.

NAMD está disponible como software gratuito para uso no comercial por parte de individuos, instituciones académicas y corporaciones para usos empresariales internos.