En bioinformática, miRBase es una base de datos biológica que actúa como archivo de secuencias y anotaciones de microARN. En septiembre de 2010 contenía información sobre 15.172 microARN. Este número ha aumentado a 38.589 en marzo de 2018. El registro miRBase proporciona un sistema centralizado para asignar nuevos nombres a los genes de microARN.
microRNA database
Universidad de Manchester
Ana Kozomara
Kozomara &al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase surgió a partir del recurso de registro de microARN creado por Sam Griffiths-Jones en 2003.
Según Ana Kozomara y Sam Griffiths-Jones miRBase tiene cinco objetivos:
- Proporcionar un sistema de nomenclatura coherente para los microARN
- Proporcionar un lugar central que recoja todas las secuencias de microARN conocidas
- Proporcionar información legible para humanos y ordenadores para cada microRNA
- Proporcionar pruebas primarias para cada microRNA
- Agregar y enlazar con la información de las dianas de los microRNAs
MiRBase contiene miRNAs pertenecientes a varias especies pertenecientes a Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae y Virus. Para los Viridiplantae, en la versión 21 (2014) hay datos disponibles para 73 especies. Esto incluye 4800 miRNAs maduros únicos y 8480 secuencias precursoras.
La versión actual de MiRBase es la versión 22 (marzo de 2018).