El Schwarzer Kocher nace al sur de Oberkochen. La segunda fuente, el Weißer Kocher nace al oeste de Unterkochen a partir de muchas fuentes pequeñas. El nombre de Weißer Kocher proviene de la espuma blanca del agua cuando se precipita rápidamente sobre las piedras. En cambio, el Schwarzer Kocher fluye con bastante lentitud y el suelo cubierto da al agua un color oscuro. Ambas cabeceras se unen en Unterkochen y fluyen hacia el norte a través de la ciudad de Aalen y Wasseralfingen hasta Hüttlingen, donde el Kocher gira hacia el oeste en dirección a Abtsgmünd. Aquí el río Lein desemboca en el Kocher. A continuación, el Kocher sigue hacia el noroeste hasta Unterrot, donde recibe el río Rot y continúa hasta las ciudades de Gaildorf y Schwäbisch Hall. Cerca de Geislingen, el río Bühler desemboca en el Kocher. En una amplia curva, el Kocher vuelve a girar hacia el oeste, adentrándose en la llanura de Hohenlohe y pasando por Künzelsau. Continúa hasta Neuenstadt am Kocher, donde recibe el río Brettach. Cerca de Bad Friedrichshall, el Kocher desemboca en el Neckar, a pocos kilómetros aguas arriba de la desembocadura del río Jagst, que fluye más o menos paralelo al noreste del Kocher.
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