Johnny Sauter comenzó a competir en 1996, tras cumplir la promesa que le hizo a su padre, el piloto de circuitos cortos Jim Sauter, de terminar la escuela secundaria antes de comenzar su carrera. El nativo de Necedah, Wisconsin, se unió a la American Speed Association (ASA) en 1998. En 2001, dirigido por el jefe de equipo Joe Shear, Jr., Sauter fue nombrado Campeón de la ASA y Novato del Año con un récord de 10 victorias.

Ese mismo año hizo su primera salida en lo que ahora se conoce como la NASCAR Xfinity Series. Compartió la conducción en la temporada 2003, ganando el Campeonato de Propietarios de la Xfinity. Sauter también hizo su debut en la NASCAR Cup Series y su debut en la NASCAR Camping World Truck Series ese año.

Sauter se trasladó a los camiones a tiempo completo en 2009 y obtuvo su primera victoria en Las Vegas Motor Speedway ese año. En 2016, Sauter se adjudicó su primer campeonato de pilotos de la serie tras una temporada que incluyó tres victorias, una pole, 12 top 5 y 19 top 10 en su carrera.

Sauter continuó ganando su lugar en los libros de récords en 2017 y 2018, ganando 10 carreras adicionales y asegurando el cuarto puesto en el campeonato en ambas temporadas; convirtiéndose en el único piloto de la serie en aparecer en las tres batallas por el campeonato desde el inicio del formato Chase

Como un verdadero corredor, Sauter continúa compitiendo a nivel local en su estado natal de Wisconsin, donde reside con su esposa Cortney y sus cuatro hijos.