Los convincentes éxitos militares de Cromwell en Drogheda en Irlanda (1649), Dunbar en Escocia (1650) y Worcester en Inglaterra (1651) obligaron al hijo de Carlos I a exiliarse en el extranjero a pesar de ser aceptado y coronado rey en Escocia.
De 1649 a 1660, Inglaterra fue, por tanto, una república durante un periodo conocido como el Interregno («entre reinados»). Siguieron una serie de experimentos políticos, mientras los gobernantes del país intentaban redefinir y establecer una constitución viable sin monarquía.
Durante el Interregno, la relación de Cromwell con el Parlamento fue problemática, con tensiones sobre la naturaleza de la constitución y la cuestión de la supremacía, el control de las fuerzas armadas y el debate sobre la tolerancia religiosa.
En 1653 el Parlamento fue disuelto, y bajo el Instrumento de Gobierno, Oliver Cromwell se convirtió en Lord Protector, rechazando más tarde la oferta del trono.
Siguieron más disputas con la Cámara de los Comunes; en un momento dado Cromwell recurrió al gobierno regional por parte de varios Generales Mayores del ejército. Tras la muerte de Cromwell en 1658, y el fracaso del efímero Protectorado de su hijo Ricardo, el ejército bajo el mando del general Monk invitó al hijo de Carlos I a convertirse en rey como Carlos II.