La ciudad más septentrional de Alemania cuenta con más de 700 años de historia germano-danesa, algunos de los cuales fueron bastante pintorescos. Reinada por los daneses durante más de 400 años, sigue siendo una puerta a los países escandinavos y, con sus 88.000 habitantes, es la tercera ciudad más grande de Schleswig-Holstein.
La región que rodea a Flensburg fue atractiva para los colonos desde muy pronto. Antes del año 1200, la primera comunidad de pescadores daneses construyó un pequeño pueblo de comerciantes alrededor de la iglesia de Johannis, en el extremo protegido del estuario de Flensburg. Aquí confluían dos importantes rutas de tráfico, la más importante de las cuales era la conexión entre el norte y el sur, donde ahora se encuentra la autopista A7. Cuando el príncipe Abel reinaba en la región, Flensburgo se acercó a la Liga Hanseática y ganó a Lübeck, Stralsund y Wismar como socios comerciales. Ya el 29 de diciembre de 1284 se concedieron a la ciudad ordenanzas y privilegios. Fue entonces cuando las zonas de Nordermarkt, con Santa María, y Südermarkt, con San Nicolás, adquirieron mayor importancia. Fueron los centros de una ciudad que rápidamente pasó de ser un antiguo pueblo de pescadores a una ciudad comercial. Incluso el actual Kloster zum Heiligen Geist ya existía en aquella época – era un monasterio franciscano.
En 1411 el rey Erich hizo construir el Duburg para su protección, y en 1443 se construyó el Ayuntamiento. En 1460, Christian I de Dinamarca se convirtió en Duque de Schleswig y Conde de Holstein. En aquella época, Flensburg experimentaba un considerable crecimiento económico y se había convertido en una de las ciudades comerciales más importantes del reino danés. Consistía casi exclusivamente en la milla a lo largo del estrecho de Holm-Groe-Norderstrae. Los comerciantes vivían en casas largas y estrechas en los barrios orientales que daban al estrecho, mientras que los artesanos vivían en el otro lado. Muchos de los hermosos almacenes de los mercaderes aún pueden verse hoy en día. Se utilizan como pisos y a veces se encuentran pequeños negocios en sus sótanos.
En el siglo XVI, con sus 200 barcos, Flensburg se convirtió en la ciudad comercial danesa más importante de la región del Báltico. En 1525, la Reforma llegó a la ciudad, y en 1544 el rey Christian III introdujo leyes sobre la moneda. En 1566 comenzó la enseñanza en el Antiguo Gimnasio (escuela de latín) y en 1595 se construyeron el Schrangen y el Nordertor. La puerta se utilizó para marcar los límites del norte de la ciudad durante 200 años. Alrededor de 1600, Flensburg contaba con unos 6.000 habitantes, y en 1602 se erigió la Kompagnietor. Además de la economía de la ciudad, el arte, la literatura y la ciencia florecieron hasta que el inicio de la Guerra de los Treinta Años (1618-48) y la Guerra del Norte (1700-21) destruyeron toda la riqueza durante mucho tiempo.
Hacia finales del siglo XVIII, sin embargo, la navegación, la construcción naval, las relaciones comerciales y la artesanía se recuperaron y se fortalecieron. Además de contar con Noruega y el Mediterráneo como socios comerciales, el comercio de ron con las Indias Occidentales se convirtió en un factor económico crucial. Flensburg debe su fama de < i>ciudad del ron a esta época. El Museo de la Navegación y el Comercio del Ron tiene expuestos algunos documentos muy interesantes de esta época. Unos 300 barcos de Flensburg surcaban los mares entonces, y se establecieron refinerías, molinos de aceite, fábricas de jabón y tabaco y más de 200 destilerías para procesar los productos importados y locales. El primer periódico local se publicó en 1766, y entre 1852 y 1856 se construyó el ferrocarril de Südschleswigsche, que conectaba Flensburg, Husum y Tönning. Se suponía que iba a convertirse en un rival del canal Nord-Ostsee, pero eso nunca ocurrió. En 1886 se puso en funcionamiento el primer ferrocarril prusiano de vía estrecha, que en la década de 1950 seguía llevando a los viajeros de ida y vuelta a Kappeln.
En el siglo XIX los países vecinos de Alemania y Dinamarca iniciaron una larga lucha por la valiosa región fronteriza que rodea Flensburg. Los monumentos de guerra en el Sankelmark y en Bilschau, así como en los campos de batalla de Bov (DK) y Oeversee todavía conmemoran estas luchas. La revuelta de Schleswig-Holstein contra Dinamarca (1848-51) desencadenó una etapa en la que Flensburgo fue la capital de Holstein y, tras la crisis económica mundial de 1857, desembocó en la guerra germano-danesa de 1864. Como resultado de esta guerra, Schleswig-Holstein cayó bajo el reinado austriaco y prusiano. En 1867, Schleswig-Holstein – y con él Flensburg – se convirtió en una provincia prusiana, y el 22 de septiembre de 1867 nació el condado de Flensburg.
La Cámara de Comercio se fundó en 1870, el Diakonissenanstalt abrió en 1874, la oficina principal de correos de Flensburg le siguió en 1881, y el juzgado y la prisión en 1882. En 1894 se puso en funcionamiento la primera central eléctrica. En 1910 se terminó el edificio de la Academia Naval de Mürwik en su ubicación ideal en el fiordo de Flensburg. Desde entonces, los oficiales navales se han formado y se siguen formando allí. La derrota en la Primera Guerra Mundial puso fin al constante crecimiento económico de la ciudad durante un tiempo. En las elecciones del 10 de febrero y el 14 de marzo de 1920, la población de Flensburg decidió seguir formando parte de Alemania, pero la ciudad perdió unas 9.000 hectáreas de su región circundante, incluyendo 8 comunidades. A partir de entonces, Flensburg fue una ciudad fronteriza con minorías nacionales a ambos lados de esta frontera. Sin embargo, la población se mantuvo en contacto y existió una cooperación política sana y racional, así como una variedad notablemente versátil de proyectos culturales compartidos desarrollados en torno a la frontera danesa. Un gran número de nuevas escuelas y bibliotecas, por ejemplo, se crearon en la región durante los pocos años transcurridos entre el período de la inflación y la Segunda Guerra Mundial.
El aeropuerto de Schäferhaus ya estaba en funcionamiento en 1925 y la estación de ferrocarril le siguió en 1927. La Deutsches Haus en la Berliner Platz se construyó entre 1927 y 1930 para expresar el agradecimiento del Reich a la ciudad de Flensburg por su permanencia en Alemania. Hoy en día, sirve como lugar de celebración de grandes conciertos y otros eventos culturales. La primera estación central de autobuses de Alemania también se terminó de construir en Flensburgo en 1930, y ha sido completamente reformada en los últimos años. La actual Escuela de Telecomunicaciones de Mürwik fue creada en 1936/37.
Hacia el final de la Segunda Guerra Mundial, el gobierno del Reich buscó refugio en la Academia Naval de Mürwik. El almirante Dönitz estaba al mando y fue desde aquí donde declaró la capitulación de Alemania. El destino de Flensburg volvió a ser incierto.
Después de la guerra, se retomaron rápidamente los proyectos culturales, especialmente los dirigidos a los jóvenes. En 1946 se abrió la escuela de magisterio, que desde 1994 se conoce como Universidad de Flensburgo. La primera conferencia de jóvenes de la posguerra en el Scheersberg tuvo lugar en 1947. En 1950, la NWDR (ahora NDR) comenzó a emitir desde Flensburg y se fundó la Grenzakademie (academia de la frontera) en Sankelmark. En 1952, la KBA (el departamento federal de conducción), donde se cobran todos los puntos de penalización, se trasladó de Bielefeld a Flensburg.
Los problemas económicos de la posguerra se abordaron de forma decidida. Se dotó a Angeln de una moderna carretera principal y de enlaces de tráfico adecuados, y la agricultura se convirtió en el factor económico más importante de la región. El comercio y la industria, sobre todo la construcción naval, se desarrollaron en Flensburg, y el turismo se convirtió en una cuestión cada vez más importante. Alrededor del casco antiguo se desarrollaron barrios modernos con numerosas industrias, pequeños comercios y servicios, que proporcionan a la población de toda la comarca puestos de trabajo y un nivel de vida considerable. En 1964 se terminó el nuevo ayuntamiento en Pferdewasser, y en 1968 el Holm se convirtió en una zona peatonal. Hasta 1976, Nordermarkt y Groe Strae también formaban parte de la zona peatonal.
La ejemplar renovación sistemática de las casas históricas del casco antiguo se inició en la década de 1970, y sigue en curso. En 1984, Flensburg celebró 700 años de ordenanzas y privilegios municipales, y ese mismo año se inauguró el Schifffahrtsmuseum (Museo de la Navegación). En la actualidad, los visitantes pueden admirar un montón de hermosos edificios históricos y pintorescos patios con pequeños cafés y comercios, así como el casco antiguo original entre Nordermarkt y Südermarkt. El evidente ambiente escandinavo y la hermosa línea costera a lo largo del fiordo contribuyen al encanto único de Flensburg, que simplemente hay que experimentar.