Die Gründung der NCAC wurde auf gemeinsamen Pressekonferenzen in Cleveland, Columbus und Pittsburgh im Februar 1983 bekannt gegeben. Das Allegheny College, die Case Western Reserve University (CWRU), die Denison University, das Kenyon College, das Oberlin College, die Ohio Wesleyan University und das College of Wooster wurden 1984 Gründungsmitglieder, im selben Jahr, in dem der Spielbetrieb der NCAC-Leichtathletikkonferenz aufgenommen wurde.

Im Jahr 1988 nahmen das Earlham College und das Wittenberg College Einladungen an, der NCAC beizutreten, wodurch sich die Zahl der Konferenzmitglieder auf neun Schulen in drei Staaten erhöhte. Die beiden Schulen nahmen den Spielbetrieb im Herbst 1989 auf. 1998 nahmen das Hiram College und das Wabash College Einladungen zum Beitritt in die NCAC an, wodurch sich die Zahl der Konferenzmitglieder auf 10 Schulen in drei Staaten erhöhte, die beide im Herbst 1999 den Spielbetrieb aufnahmen. Case Western Reserve, ein Gründungsmitglied der NCAC, gab bekannt, dass es die NCAC nach dem akademischen Jahr 1998-99 verlassen würde. Die Spartans werden nach mehr als einem Jahrzehnt gemeinsamer Konferenzmitgliedschaft in der University Athletic Association (UAA) antreten.

Earlham kündigte an, die NCAC zu verlassen und mit Beginn der Saison 2010/11 in die Heartland Collegiate Athletic Conference (HCAC) zu wechseln. Die DePauw University wurde mit Beginn der Saison 2011/12 das 10. Mitglied der NCAC.