Die vom NPIP abgedeckten Krankheiten sind die Geflügelpest (Geflügelpest) und die von S. pullorum (Pullorum-Krankheit), S. gallinarum (Geflügeltyphus), S. enterica var. enteritidis, Mycoplasma gallisepticum (MG, chronische Atemwegserkrankung und infektiöse Sinusitis bei Truthühnern), M. synoviae (MS, infektiöse Synovitis) und M. meleagridis (MM, Eintagsfliegenkrankheit). Darüber hinaus gibt es im Rahmen des NPIP Programme wie „U.S. Salmonella Monitored“ und „U.S. Sanitation Monitored“, die das Auftreten von Salmonellen in Bruteiern, Küken und Küken durch wirksame und praxisnahe Hygienemaßnahmen im Zuchtbetrieb und in der Brüterei reduzieren sollen.

Geflügel wird im NPIP als domestiziertes Geflügel definiert, einschließlich Hühner, Truthähne, Strauße, Emus, Nashörner, Kasuare, Wasservögel und Wildvögel (außer Tauben), die in erster Linie zur Erzeugung von Eiern und Fleisch gezüchtet werden. Am NPIP sind drei Arten von Teilnehmern beteiligt: unabhängige Herden, Brütereien und Händler. Bei den vom NPIP zertifizierten Geflügelprodukten handelt es sich um Bruteier, Babyküken, Küken und Junghennen. Die überwiegende Mehrheit der US-Bundesstaaten verbietet die Einfuhr von Geflügelsendungen mit Ausnahme derjenigen, die als Pullorum-Typhus-frei ausgewiesen sind. Im Wesentlichen bedeuten solche Verbote, dass Geflügel, das zwischenstaatlich transportiert wird, am „U.S. Pullorum-Typhoid Clean“-Programm des NPIP teilnehmen oder vor dem Verlassen des Heimatstaates negativ auf Pullorum-Typhus getestet werden muss. Fünfzehn Bundesstaaten verlangen, dass alle Sendungen von Truthühnern, die sie erhalten, MG clean sind. Im Wesentlichen bedeutet diese Anforderung, dass Truthähne, die zwischenstaatlich transportiert werden, am „U.S. MG Clean“-Programm des NPIP teilnehmen oder vor dem Versand auf MG getestet werden müssen.

Die meisten US-Handelspartner, die Geflügel und Produkte aus den Vereinigten Staaten importieren, verlangen ebenfalls die Teilnahme am NPIP. Akkreditierte Tierärzte können aufgefordert werden, am NPIP teilnehmende Zuchtherden auf die Einhaltung der Standards zu untersuchen und Gesundheitsbescheinigungen auszustellen. Jedes Frühjahr veröffentlicht APHIS ein Verzeichnis der Teilnehmer, die mit Ei- und Fleischhühnern und Truthühnern umgehen, sowie ein Verzeichnis der Teilnehmer, die mit Wasservögeln, Ausstellungsgeflügel, Wildvögeln und Laufvögeln umgehen. In diesen Verzeichnissen sind Brütereien, unabhängige Herden und Händler, die am NPIP teilnehmen, die Produkte, mit denen sie umgehen, und die Krankheitsklassifikationen, an denen sie teilnehmen, aufgeführt.