In der Bioinformatik ist miRBase eine biologische Datenbank, die als Archiv für microRNA-Sequenzen und -Anmerkungen dient. Im September 2010 enthielt sie Informationen über 15.172 microRNAs. Diese Zahl hat sich bis März 2018 auf 38.589 erhöht. Das miRBase-Register bietet ein zentrales System für die Vergabe neuer Namen für microRNA-Gene.
microRNA database
University of Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase entstand aus der 2003 von Sam Griffiths-Jones eingerichteten microRNA-Registrierungsressource.
Nach Angaben von Ana Kozomara und Sam Griffiths-Jones verfolgt miRBase fünf Ziele:
- Ein einheitliches Benennungssystem für microRNAs zu schaffen
- Eine zentrale Stelle zu schaffen, die alle bekannten microRNA-Sequenzen sammelt
- Menschliche und computerlesbare Informationen für jede microRNA
- Zur Verfügung stellen von primären Beweisen für jede microRNA
- Zusammenfassen und Verlinken von microRNA-Zielinformationen
MiRBase enthält miRNAs von verschiedenen Arten, die zu Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae und Viren. Für die Viridiplantae sind in Version 21 (2014) Daten für 73 Arten verfügbar. Dies umfasst 4800 einzigartige reife miRNAs und 8480 Vorläufersequenzen.
Die aktuelle Version von MiRBase ist Release 22 (März 2018).