Um die Gene und Genfunktionen zu identifizieren, die den Schlüsselaspekten der Leguminosenbiologie zugrunde liegen, haben Forscher die kühl wachsende Leguminose Medicago truncatula als Modellsystem für die Leguminosenforschung ausgewählt. Die Aufgabe des M. truncatula-Konsortiums besteht darin, die uneingeschränkte gemeinsame Nutzung von Daten und Informationen zu fördern, die von Medicago-Forschungsgruppen weltweit bereitgestellt werden. Durch die Integration einer Vielzahl von Daten und Werkzeugen soll die Website medicago.org Fortschritte in den Bereichen der strukturellen, vergleichenden und funktionellen Genomik ermöglichen. Zu diesem Zweck hat das Center for Computational Genomics and Bioinformatics (CCGB) an der Universität von Minnesota als Konsortialpartner MtDB2.0, die M. truncatula-Datenbank Version 2.0, entwickelt. Die MtDB2.0-Datenbank ist der erste Schritt zur globalen Integration von genomischen, genetischen und biologischen Informationen über M. truncatula. MtDB2.0 ist eine relationale Datenbank, die M. truncatula-Transkriptomdaten integriert und eine breite Palette von benutzerdefinierten Data-Mining-Optionen bietet. Die Datenbank wird über eine Reihe von Schnittstellen abgefragt, wobei 58 Optionen in zwei Filtern gruppiert sind. Die Sequenzbezeichner aller öffentlichen M. truncatula-Websites sind vollständig mit Querverweisen versehen, um Vergleiche zwischen verschiedenen Websites zu erleichtern, und für alle Abfrageergebnisse werden Hypertext-Links zu den entsprechenden Datenbankeinträgen bereitgestellt. Das Ziel von MtDB ist es, Forschern die Möglichkeit zu geben, schnell und unabhängig Sequenzen zu identifizieren, die bestimmten Forschungsinteressen auf der Grundlage von benutzerdefinierten Kriterien entsprechen. MtDB2.0 bietet uneingeschränkten Zugang zu fortschrittlichen und leistungsstarken Abfragetools, die von keiner anderen öffentlichen Datenbank erreicht werden. Structurad Query Language (SQL)-kodierte Abfragen mit einer Java-basierten Web-Benutzerschnittstelle enthalten verschiedene Filter, die ein ausgeklügeltes Data Mining der Expressed Sequence Tag Sequenzier-Projektergebnisse ermöglichen, einschließlich des CCGB M. truncatula Unigene Sets, das mit dem Phrap Assembler erzeugt wurde. Die zugrundeliegende Datenbank und die Abfragesoftware wurden so konzipiert, dass sie leicht aktualisiert werden können und auf andere Modellorganismen übertragbar sind. Der öffentliche Zugang zur Datenbank ist unter http://www.medicago.org/MtDB zu finden.