Genekspression i heterogenitet

Joseph Rodriguez, Ph.D.
Principal Investigator Tlf. 984-287-3104
[email protected]

Research Summary

Den nuværende teknologi gør det muligt for gruppen at afbilde transkriptionssteder i realtid, hvilket fører til en forståelse af, hvordan heterogeniteten i genekspression reguleres.

Joseph Rodriguez, Ph.D., leder Single Cell Dynamics Group og har en sekundær ansættelse i NIEHS Signal Transduction Laboratory. Single Cell Dynamics Group undersøger, hvordan miljøet påvirker ekspressionsvariabiliteten på enkeltcelleniveau og efterfølgende, hvordan denne variabilitet påvirker beslutninger om cellens skæbne.

Gruppens forståelse af genregulering er for det meste baseret på undersøgelser, der analyserer hele væv og bulkcellelysater. Single Cell Dynamics Group er interesseret i at forstå, hvorfor genetisk identiske celler reagerer heterogent på miljømæssige stimuli. Nyere forskning tyder på, at ekspressionsvariabiliteten øges i væv i forbindelse med sygdomme som f.eks. kræft eller aldringsprocessen. Ved at finde frem til de faktorer og mekanismer, der regulerer denne variabilitet, vil vi kunne forstå forskellene mellem normale og syge tilstande.

Hovedområder inden for forskning:

• Definering af mekanismerne bag ekspressionsheterogenitet
• Bestemmelse af, hvordan beslutninger om celleskæbne reguleres i enkelte celler

Billeddannelse af transkription i levende celler afslører dybe repressive perioder, der forårsager ekspressionsheterogenitet.

Rodriguez blev færdiguddannet fra MIT i 2001 og arbejdede i seks år med bioinformatisk analyse af samling af det menneskelige genom i seks år. I 2007 begyndte han at arbejde under ledelse af Nobelprismodtager Michael Rosbash, Ph.D., på Brandeis University, hvor han studerede RNA-processering og cirkadisk genekspressionsdynamik. Dette arbejde førte til fælles forfatterskab på elleve publikationer, herunder førsteforfatterartikler i Molecular Cell og Proceedings of the National Academy of Sciences. Efter at have modtaget sin ph.d. i 2012 blev Rodriguez ansat i Daniel Larsons laboratorium ved National Cancer Institute og studerede transkriptionel regulering af østrogenresponsive gener i enkelte menneskelige celler. Han kom til NIEHS i 2018.