Det er ukendt, hvad der er sket.

Vi ved dog, hvad der ikke er sket. En populær fan-teori er, at der var en slags Kataklysm, hvor Zero brød løs og dræbte alle. Dette er blevet udtrykkeligt afvist af Keiji Inafune selv.

Wily antydes at have overlevet gennem Maverick-virussen og er helt sikkert den, der skabte den og Zero. Det er der i hvert fald ingen tvivl om.

Hvis jeg skulle gætte: Roll endte sandsynligvis med at blive slidt op senere.

Blues/Protoman døde sandsynligvis af sin energi-ubalance.

Det er sandsynligt, at Megaman og Forte/Bass til sidst slog hinanden ihjel.

Lights helbred var tydeligvis svækket i Day of Sigma-flashbacks, så det er sandsynligt, at han simpelthen døde af naturlige årsager.

Det er stærkt antydet, men aldrig bekræftet, at Wily uploadede sit sind til en computer.

En alternativ skæbne for Megaman kunne være denne: En af Dr. Wilys robotmestre er Quint, en omprogrammeret version af Megaman, som Wily stjal fra 34 år ud i fremtiden. På det tidspunkt var Megamans kamp slut, og han havde fået fjernet sine kampdele, så Wily gav ham nye dele i et forsøg på at dræbe sit tidligere jeg. Megaman besejrede ham naturligvis, men, og dette er baseret på min hukommelse, jeg har ikke noget som helst til at underbygge dette, jeg er ret sikker på, at Quint faktisk ikke blev ødelagt.

Jeg er ikke sikker på, hvad der skete der.