Sygdommene, der er omfattet af NPIP, er aviær influenza (fjerkræpest) og sygdomme, der produceres af S. pullorum (pullorum disease), S. gallinarum (tyfus hos fjerkræ), S. enterica var. enteritidis, Mycoplasma gallisepticum (MG, kronisk luftvejssygdom og infektiøs bihulebetændelse hos kalkuner), M. synoviae (MS, infektiøs synovitis) og M. meleagridis (MM, daggammel luftsacculitis). Desuden har NPIP programmer som “U.S. Salmonella Monitored” og “U.S. Sanitation Monitored”, der har til formål at reducere forekomsten af salmonellaorganismer i rugeæg, kyllinger og kyllinger ved hjælp af effektive og praktiske hygiejneprocedurer på avlsbruget og rugeriet.

Poultry defineres i NPIP som tamfjerkræ, herunder kyllinger, kalkuner, strudse, emuer, næser, kasuarier, vandfugle og fuglevildt (undtagen duer og duer), der primært opdrættes til produktion af æg og kød. Der er tre typer deltagere involveret i NPIP: uafhængige flokke, rugerier og forhandlere. De fjerkræprodukter, der er certificeret af NPIP, er rugeæg, små kyllinger, kyllinger og startede høns. Langt de fleste af USA’s stater forbyder indførsel af alle fjerkræforsendelser undtagen dem, der er erklæret pullorum- og tyfusfrie. Sådanne forbud betyder i det væsentlige, at fjerkræ, der transporteres mellem stater, skal deltage i NPIP’s “U.S. Pullorum-Typhoid Clean”-program eller testes negativt for pullorum-typhoid, inden det forlader sin hjemstat. Femten stater kræver, at alle forsendelser af kalkuner, de modtager, skal være MG-rene. Dette krav betyder i alt væsentligt, at kalkuner, der transporteres mellem stater, skal deltage i NPIP’s “U.S. MG Clean”-program eller testes for MG inden forsendelse.

De fleste amerikanske handelspartnere, der importerer fjerkræ og produkter fra USA, kræver også deltagelse i NPIP. Akkrediterede dyrlæger kan blive anmodet om at inspicere avlsflokke, der deltager i NPIP, for at sikre, at standarderne overholdes, og for at udstede sundhedscertifikater. APHIS offentliggør hvert forår en fortegnelse over deltagere, der håndterer høns og kalkuner af æg- og kødtypen, og en fortegnelse over deltagere, der håndterer vandfugle, udstillingsfjerkræ, fuglevildt og strudsefugle. Disse fortegnelser indeholder en liste over rugerier, uafhængige flokke og forhandlere, der deltager i NPIP, de produkter, de håndterer, og de sygdomsklassifikationer, de deltager i.