Motagua-floden, spansk Río Motagua, flod i det østlige Guatemala, der udspringer i det centrale højland i nærheden af Chichicastenango. Motagua er Guatemalas længste flod og måler ca. 400 km (250 miles). Den løber generelt mod øst og nordøst og munder ud i Omoa-bugten ud for Hondurasbugten ved den honduranske grænse. I nærheden af dens udspring kaldes den lokalt Silbapec-floden og længere nedstrøms som Río Grande. Bjergkæderne Chuacús, Minas og San Isidro rejser sig fra Motagua-flodens venstre bred; de vigtigste bifloder, herunder Chiquimula-floden, løber fra syd. Motagua er sejlbar med lavvandede både ca. 200 km opstrøms fra dens munding og er en vigtig transportåre for bananer, kaffe og andre frugter, der dyrkes i dalene i den østlige del af floden. United Fruit Company begyndte omfattende bananaktiviteter i floddalen i 1904. Der findes en del guldminedrift langs flodens løb. Jernbanen Puerto Barrios-Guatemala City og Atlantic Highway følger floddalen opstrøms indtil El Progreso.