I bioinformatik er miRBase en biologisk database, der fungerer som et arkiv for mikroRNA-sekvenser og annotationer. I september 2010 indeholdt den oplysninger om 15 172 microRNA’er. Dette antal er steget til 38.589 i marts 2018. miRBase-registret er et centraliseret system til tildeling af nye navne til microRNA-gener.
microRNA database
University of Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase voksede ud af den microRNA-registerressource, der blev oprettet af Sam Griffiths-Jones i 2003.
I henhold til Ana Kozomara og Sam Griffiths-Jones har miRBase fem mål:
- At tilvejebringe et konsistent navngivningssystem for microRNA’er
- At tilvejebringe et centralt sted, der samler alle kendte microRNA-sekvenser
- At tilvejebringe oplysninger, der kan læses af mennesker og computere, for hver microRNA
- At tilvejebringe primær dokumentation for hvert microRNA
- At samle og linke til information om microRNA-mål
MiRBase indeholder miRNA’er, der tilhører forskellige arter, der tilhører Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae og Virusser. For Viridiplantae er der i udgivelse 21 (2014) data til rådighed for 73 arter. Dette omfatter 4800 unikke modne miRNA’er og 8480 forløbersekvenser.
Den aktuelle version af MiRBase er release 22 (marts 2018).