Milton Obote, i sin fulde betydning Apollo Milton Obote, (født 28. december 1924 i landsbyen Akoroko, Lango, Uganda – død 10. oktober 2005 i Johannesburg, Sydafrika), politiker, der var premierminister (1962-70) og to gange præsident (1966-71, 1980-85) for Uganda. Han førte sit land til uafhængighed i 1962, men hans to embedsperioder (som begge blev afsluttet ved militærkup) blev opslugt af kampe mellem Ugandas nordlige og sydlige etniske grupper.

Obote blev født som det tredje af ni børn i en landmandsfamilie i det nordlige og centrale Uganda. Han gik først på Busoga College i Mwiri og derefter på Makerere College i Kampala fra 1948 til 1949, men han blev bortvist fra sidstnævnte på grund af sine politiske aktiviteter, inden han nåede at få sin eksamen. Den britiske kolonistyre forhindrede ham i at tage imod stipendier til at studere i USA og Vesttyskland, og i 1950 rejste Obote til Kenya. Der blev han, mens han arbejdede som arbejdsmand, kontorist og sælger, involveret i uafhængighedsbevægelsen og blev medlem af Kenya African Union.

Obote vendte tilbage til Uganda i 1957 og blev medlem af Uganda National Congress Party. I 1958 blev han valgt til at repræsentere sit hjemstedistrikt i det lovgivende råd, hvor han, på trods af at han var en af få afrikanske delegerede, ikke tøvede med at kritisere den britiske regering. Da National Congress Party splittede sig, dannede han Uganda People’s Congress (UPC), som især fik sin støtte fra de nordlige Acholi- og Lango-folk. UPC’s vigtigste politiske fokus var modstand mod det magtfulde sydlige kongerige Buganda under kong Mutesa II. Efter at være blevet premierminister i 1962 accepterede Obote en forfatning, der gav fem traditionelle kongedømmer, herunder Buganda, føderal status i Uganda. Han var således i stand til at danne en regeringskoalition bestående af sit UPC og Bugandas Kabaka Yekka-parti (“Kongen alene”). I 1963 blev Mutesa valgt til den (overvejende ceremonielle) præsidentpost med Obotes opmuntring.

I 1966 nåede konflikten mellem Obote og Buganda imidlertid sit højeste punkt. Obote sendte tropper under ledelse af Idi Amin, en officer fra et nordligt distrikt, til at angribe Mutesas palads, og Mutesa flygtede til Storbritannien. I et forsøg på at befæste sit styre indførte Obote en ny forfatning, der afskaffede alle kongedømmer og andre rester af føderalisme i landet. Den nye forfatning indførte også et udøvende præsidentembede, som Obote overtog, mens han fortsat fungerede som premierminister. Men Obotes stigende afhængighed af militæret og politiet til at terrorisere sine politiske modstandere vakte vrede hos de sydlige ugandere, og det gav Amin mulighed for at opbygge et følge baseret på rekrutter fra sit eget Kakwa-folk. I begyndelsen af 1971 blev Obote væltet ved et kup ledet af Amin.

Obote bosatte sig i nabolandet Tanzania, hvor han opretholdt en lille emigranthær under ledelse af generalen Tito Okello, en acholi. Denne hær hjalp de tanzanianske styrker med at afsætte Amin i 1979, og Okello var i stand til at sikre Obotes valg til præsidentembedet efter Obotes hjemkomst fra eksil i maj 1980. Som præsident anmodede Obote om udenlandsk bistand i et forsøg på at få Ugandas økonomi til at rejse sig fra Amin-årenes ruin, men han gjorde intet for at forhindre acholi- og langosoldater i at gennemføre en mord- og plyndringskampagne i syd og i Amins hjemdistrikt. I 1985 blev Obote tvunget ud af sit embede af Okello. Han bosatte sig til sidst i Zambia, men fortsatte med at spille en aktiv rolle i UPC indtil sin død i 2005.