Johnny Sauter begyndte at køre racerløb i 1996, efter at han havde indfriet et løfte til sin far, short-track racerkører Jim Sauter, om at afslutte gymnasiet, før han begyndte sin karriere. Den i Necedah, Wisconsin fødte kører blev medlem af American Speed Association (ASA) i 1998. I 2001 blev Sauter under ledelse af teamchef Joe Shear, Jr. udnævnt til ASA-mester og årets rookie med en rekord på 10 sejre.

Samme år tog han sin første start i det, der nu er kendt som NASCAR Xfinity Series. Han delte kørslen i 2003-sæsonen og vandt Xfinity Owners Championship. Sauter fik også sin debut i NASCAR Cup Series og sin debut i NASCAR Camping World Truck Series det år.

Sauter skiftede til Trucks på fuld tid i 2009 og fik sin første sejr på Las Vegas Motor Speedway det år. I 2016 vandt Sauter sit første kørermesterskab i serien efter en sæson, der omfattede tre sejre, en pole position, 12 top-fem-taller og 19 top-ti-placeringer, hvilket var karrierens højdepunkt.

Sauter fortsatte med at gøre sig fortjent til sin plads i rekordbøgerne i 2017 og 2018, idet han vandt yderligere 10 løb og sikrede sig fire pladser i mesterskabet i begge sæsoner; han blev den eneste kører i serien til at deltage i alle tre mesterskabskampe siden indførelsen af Chase-formatet

Som en ægte rigtig racerkører fortsætter Sauter med at konkurrere på lokalt plan i sin hjemstat Wisconsin, hvor han bor sammen med sin kone Cortney og deres fire børn.