Makrofyter
Makrofyter (bokstavligen ”stora växter”) är enskilda vattenväxter som kan ses med blotta ögat. Makrofyter kan kategoriseras utifrån var och hur de växer.
Rotbaserade makrofyter har rötter i flodbädden eller sjösubstratet och är därför begränsade till områden där flödet är tillräckligt lågt för att fina sediment ska kunna ansamlas. Rotade makrofyter kan ha blad som är helt nedsänkta (under vattnet), som flyter på ytan eller som är uppkomna ovanför ytan. I grumligt vatten tränger lite ljus in och fotosyntesen är begränsad, varför endast växter med flytande eller uppstående blad kan trivas. Makrofyter med rötter kan utvinna näringsämnen från substratet och även absorbera dem från vattnet som alger gör.
Flytande akvatiska makrofyter är rotlösa växter som endast lever kvar i bakvattenområden där flödet avtar – i annat fall transporteras de nedströms. Eftersom deras fotosyntetiska ytor ligger ovanför vattenytan kan dessa växter växa i djupt, grumligt vatten och på platser där det är ont om rotplatser.
Förekomsten av makrofyter kan fluktuera säsongsmässigt som ett resultat av att bottensedimenten skuras och att växterna sköljs bort vid kraftiga regn. Av denna anledning är antalet makrofyter i flodkanaler generellt sett högst under perioder med lågt flöde.
Akvatiska makrofyter är viktiga i många akvatiska system, särskilt våtmarker, långsammare vatten i bäckar och floder och i grundare områden i sjöar. Vattenmakrofyter tillför tredimensionell komplexitet till vattenbiotopen och kan ge livsmiljöer, skydd och lekområden för djur som vattenlevande insekter och fiskar samt utgöra en yta för perifytontillväxt. Eftersom de är primärproducenter producerar akvatiska makrofyter organiskt material som kan ätas av vissa fiskar, men det mesta av växtmaterialet är oätligt för växtätare medan det lever. Energi överförs till djuren främst när den döda växtvävnaden och tillhörande nedbrytare äts.
Stora populationer av akvatiska makrofyter kan ha negativa effekter på akvatiska ekosystem och de människor som är beroende av dem. I vissa fall är de flytande växterna så talrika att de bildar täta mattor som täcker vattenytan. Deras flytande bladkronor flyter ihop ovanför ytan medan rotmassorna dinglar ner i vattnet. Den sammanfogade vegetationsmattan blockerar ljuset nedåt i vattenpelaren och hindrar andra växter från att växa. I extrema fall blir det underliggande vattnet syrefattigt, och de flytande växterna blir en olägenhet genom att de hindrar båtar från att passera och stör fisket. Invasiva arter av makrofyter kan vara särskilt störande för naturliga akvatiska ekosystem.
Riparivegetation
Riparivegetation är växtlighet som kantar flodbankerna i floder och andra inlandsvattendrag. Växterna skyddar flodbankerna från vågrörelser och erosion och erbjuder skydd, födosöks- och fortplantningsområden för fiskar, fåglar och andra organismer. Löv, kvistar och annat organiskt material från strandvegetationen kan ge betydande mängder organiskt material till bäckar och floder. Den strandnära zonen kan innehålla en mängd olika växter – från gräs till träd – ofta i en gradvis övergång med avståndet från stranden, vilket återspeglar olika arters tolerans för markmättnad.