Klinisk medicin betjänas i första hand av Bodleian Health Care Libraries på fyra platser som innehåller samlingar av aktuellt material. Bodleian Health Care Libraries tillgodoser både universitetets och den lokala NHS-personalen. Specialiteterna är följande:

Cairns Library, John Radcliffe Hospital: Akut allmänmedicin/kirurgi (alla discipliner), obstetrik och gynekologi, pediatrik, geratologi, aids, neurovetenskap, hörsel- och halsläkare, ögonläkare och kursböcker.

Knowledge Centre, Old Road Campus Research Building: Epidemiologi, evidensbaserad hälso- och sjukvård, hälsopolitik, folkhälsovetenskap, statistik, diabetes, onkologi, strålbehandling.

NOC-bibliotek, Nuffield Orthopaedic Centre: Orthopaedics, Musculoskeletal Sciences, Rheumatology, Neurological Diseases and Neurorehabilitation, Orthotics, Prosthetics, Physiotherapy, Occupational Therapy, Health Management, and Nursing.

Horton Library, Horton General Hospital: Allmänmedicin, obstetrik och gynekologi, sjuksköterska och barnmorska, neonatologi, gastroenterologi och hepatologi, pediatrik, gerontologi, kardiologi, andningsmedicin, trauma och ortopedi, endokrinologi, psykiatri och mental hälsa, psykologi, akutmedicin, intensivvårdsmedicin, kirurgi och anestesiologi, patologi, mikrobiologi och hälso- och sjukvårdsförvaltning.

Nonklinisk medicin betjänas främst av Radcliffe Science Library. Dess omfattande samlingar inom biovetenskap och medicin har anor från 1800-talet, inklusive lagstadgad deponering och inköpt material av både historiskt och samtida intresse. Här samlas material med lagstadgad deponering inom klinisk medicin och material med lagstadgad deponering och inköpt material inom icke-kliniska ämnen som experimentell psykologi, mänsklig anatomi och genetik, fysiologi, patologi och farmakologi.